20世纪90年代以来,伴随知识经济兴起,国际证券市场中的创业板市场发展迅速,旨在为需要大量资金来支持技术研发的科技创新型企业提供一个高效的融资平台。2009年10月23日,筹备十年的中国创业板在深圳正式开板,30日首批28家创业板公司集中在深交所挂牌上市。此后,中国资本市场在为高新技术企业提供融资服务上做出了很多有益探索,但囿于种种原因,二者对接还留下了不少“缝隙”。很多发展势头良好的创新企业远赴境外上市,说明这方面仍有很大提升空间。为了补齐资本市场服务科技创新的短板,2019年6月13日,中国科创板市场在上海证券交易所正式启动。由于与创业板的定位有所重合,科创板会分流一部分创业板的科技类企业,形成相互竞争的关系。而注册制改革后,如今的创业板市场同样具备了科创板市场的某些功能,短期内也会限制科创板的发展。因此,探究中国创业板市场与科创板市场之间的联动关系,厘清创业板与科创板之间的相互作用与影响,对于实现两个股票市场的有序竞争和协同发展意义重大。对照国内外学者的相关研究,文章选取了能综合反映创业板市场和科创板市场股票表现的创业板指（399006）和科创50（000688）作为研究样本,对中国创业板市场与科创板市场的联动性进行实证分析。第一阶段,通过对创业板指和科创50进行平稳性检验和协整检验,并建立相关误差修正模型,文章研究了两个股票市场之间的长期均衡关系,结果发现创业板指与科创50之间是协整的,创业板指在一定程度上对科创50偏离长期均衡的情况起到了修正作用;第二阶段,在均衡关系既定的情况下,通过对创业板指收益率和科创50收益率进行波动性分析和相关性分析,并建立向量自回归模型,在此基础上进行格兰杰因果关系检验、脉冲响应分析以及方差分解,文章进一步研究了两个股票市场之间的短期因果关系,结果表明存在由创业板市场到科创板市场的单向格兰杰因果关系,创业板收益变动会引导科创板收益变化。基于前文的研究结论,文章最后提出建议,包括引导投资者理性投资、完善科创板市场规则和差异化上市公司,旨在削弱创业板与科创板的联动性,增强科创板市场的独立性。