siRNA对流感病毒血凝素及神经氨酸酶基因的抑制作用及其在病毒重配中应用的研究

来源 :中国食品药品检定研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:NobelHsu
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siRNA是广泛存在于生物体内的非编码RNA,其介导的RNAi过程可高效、特异的沉默靶基因,被广泛应用于抗病毒的研究中。已有研究表明,针对流感病毒M,NP等基因的siRNA能够通过抑制基因表达,抑制病毒的增殖。本研究制备了多条针对PR8病毒抗原基因HA和NA的siRNA,测定了其对流感病毒的抑制作用及对基因组的影响。此外,本研究还尝试利用siRNA进行流感病毒疫苗株的重配。在第一部分中,设计了PR8病毒特异地siRNA。通过测序获得疫苗株PR8和野毒株H3N2的序列,根据siRNA设计规则设计了针对PR8病毒HA、NA基因的特异性siRNA。通过序列比对检测并排除与H3N2同源的siRNA序列,最终设计并合成针对PR8的HA和NA基因的特异性siRNA序列共12条。其中包括HA和NA特异的长度为19nt的common siRNA各3条以及长度为25bp的stealth siRNA各3条。在第二部分中,检测了siRNA的抑制效果及特异性。分别在MDCK和MTY6细胞上优化了siRNA抑制实验的转染试剂、浓度及收毒时间等条件。根据优化的条件,通过NA活性、CCID50实验检测了NA特异的siRNA单条、两条及三条联合使用对PR8的抑制效果。结果显示:NA-105与NA-199联合使用的抑制效果最明显,抑制率为86.07%,且不与H3N2发生非特异反应。通过NA活性及血凝实验检测了HA特异的siRNA的抑制效果,显示:HA-56与HA-802联合使用抑制效果明显,抑制率为57.88%,且不与H3N2发生非特异反应。HA与NA特异的siRNA联合使用对PR8的抑制效率,约为95%,高于上述HA或NA siRNA各自联合使用的抑制效果,且对H3N2无抑制作用,特异性好。在第三部分中,用HA和NA特异的siRNA进行PR8与H3N2病毒的重配。采用三种方式制备病毒混合液:(1)在MTY6细胞上分别先后感染PR8和H3N2,细胞病变90%时收获病毒混合液;(2)灭活的PR8与未灭活的H3N2共同感染鸡胚24h后收获病毒混合液;(3)灭活的H3N2与未灭活的PR8共同感染鸡胚24h后收获病毒混合液。共同转染NA-105、NA-199和HA-56、HA-802 siRNA抑制病毒混合液中的PR8病毒增殖,通过噬斑实验筛选单克隆并用RT-qPCR和RT-PCR对病毒进行鉴定。经多轮筛选鉴定并未检测到重配株存在,并对可能的原因进行了分析。在MTY6细胞上用siRNA对PR8病毒连续抑制三代后,通过深度测序检测了siRNA作用下流感病毒基因的突变情况。
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