工程化胺脱氢酶辅酶结合域的分子改造

来源 :江南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gsdfs334
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
NADH依赖型胺脱氢酶(Am DH)催化前手性酮和游离氨的不对称还原胺化途径具有反应条件温和、绿色高效及产物光学纯度高等优点,广泛应用于重要结构砌块和医药中间体手性胺的合成。对于底物结合域和辅酶结合域相互独立的Am DH,近年来主要的研究集中在对Am DH底物结合口袋关键位点的分子改造,提高Am DH底物催化活力或者拓宽其底物谱,但对辅酶结合域的改造报道较少。本研究通过对Am DH辅酶结合域进行分子改造,获得高辅酶亲和力的Am DH,提高不对称还原胺化的催化效率进而降低工业生产成本,为Am DH的工业化应用奠定基础。本论文的具体研究内容如下:(1)通过将源于Bacillus cereus的亮氨酸胺脱氢酶(L-Bc Am DH)的高辅酶亲和力辅酶结合域替换源于Bacillus badius的苯丙氨酸胺脱氢酶(F-Bb Am DH)辅酶结合域,构建获得一种新的嵌合胺脱氢酶c FLF-Am DH。使用自诱导培养基可使c FLF-Am DH实现可溶性高效表达。c FLF-Am DH辅酶亲和力(Km)较F-Bb Am DH的提高了2倍,对于天然底物对氟苯基丙酮(p FPA)的活性提高了150%。c FLF-Am DH酶学性质研究结果表明,其最适反应p H为10.0,最适反应温度为60℃。与亲本F-Bb Am DH相比,c FLF-Am DH的热稳定性提高了160%。(2)分子对接研究表明c FLF-Am DH对于底物p FPA作用的关键位点残基作用力的距离缩短,是催化活力提高的主要原因。分子动力学模拟(MD)和结合能结果表明,c FLF-Am DH与NADH复合物的RMSD的波动范围较F-Bb Am DH与NADH复合物小,并且c FLF-Am DH的RMSF值比F-Bb Am DH低,说明c FLF-Am DH的结构较亲本F-Bb Am DH更稳定。不对称还原胺化反应结果表明,当辅酶浓度为0.5 m M时,c FLF-Am DH可达到99%的转化率。(3)基于与高辅酶亲和力的亮氨酸胺脱氢酶(L-Bc Am DH和L-Es Am DH)的序列比对,选择对辅酶结合口袋附近的2个氨基酸残基(D155和K193)分别进行饱和突变和组合突变,最终获得一个辅酶亲和力和催化效率显著提高的突变株F-Bb Am DH(D155L/K193N),突变株F-Bb Am DH(D155L/K193N)对辅酶NADH的Km值为0.01 m M。(4)分子对接和酶与NADH复合物的分子动力学模拟结果表明,F-Bb Am DH的D155位点被亮氨酸(L)取代后影响了相邻残基间接改变酶与NADH之间的相互作用,K193位点被天冬酰胺(N)取代后与NADH的焦磷酸盐部分形成了更紧密的氢键。不对称还原胺化反应结果表明,当辅酶浓度为0.1 m M时,突变株F-Bb Am DH(D155L/K193N)在1 h内可达到99%的转化率。综上所述,针对工程化Am DH具有两个独立的结构域的特点,对工程化Am DH的辅酶结合域进行分子改造可获得对辅酶亲和力显著提高的突变株,进而提高催化效率,降低生产成本。
其他文献
报纸
报纸
<正>国有企业党建工作与企业发展的关系是相辅相成、相互促进的,在当前形势下如何充分发挥出国企党组织的战斗堡垒作用和党员先锋模范作用成为了国有企业需要研究的重点内容。党的十九大报告中指出,要“加强基层服务型党组织建设”,这也对国有企业的改革发展提出了新要求,为我国的经济转型升级提供了重要动力,同时也给国有企业党建工作带来了机遇与挑战。
期刊
关注学生对化学概念的理解与应用。课堂不再是利用习题对学生进行考查,而是在实践探究过程中,结合知识、过程、方法于一体,深化对概念的理解与应用。
期刊
我国对应急警务指挥体系的研究起步较晚且相对薄弱,但是其他领域和学科的相关研究较为丰富,可以作为应急警务指挥体系构建的理论指导。通过分析应急警务指挥体系的研究背景以及相关研究发展历程,在科技兴警战略背景下将“应急警务指挥体系的研究成果”分为基础理论成果、应用成果、法制成果和融合成果四类,阐述我国应急警务指挥体系的研究现状,以期对未来应急警务指挥体系研究提供参考。
期刊
<正>目的:本研究通过治疗前后自身指标的对照及治疗组与对照组的对比,探讨生脉胶囊联合耳穴压丸法对IDH气阴两虚证的治疗效果。方法:40例接受维持性血液透析治疗伴透析相关性低血压的气阴两虚证患者,随机分配到治疗组及对照组,对照组接受常规血液透析治疗,治疗组在常规血液透析治疗的基础上给予口服生脉胶囊及耳穴压丸法
会议
晚古生代太原组含煤地层主要由煤、泥岩、灰岩和砂岩等多旋回沉积组成,该层系同时是我国重要的煤系气发育层位,太原组含煤地层的沉积环境和储层特征对华北晚古生代太原组非常规天然气勘探开发具有重要意义。本文以阳泉矿区寺家庄矿为例,开展了煤和泥岩样品岩石学、元素地球化学和有机地球化学分析,对其有机质来源及有机质富集机理进行了探讨;采用气体吸附法表征煤系泥岩的孔隙结构特征,分析了孔隙发育的主控因素。结果表明:(
学位
基于ABAQUS有限元软件的热弹塑性分析方法,分析了32 mm厚Q345qD钢对焊接头在熔化极气体保护焊下的残余应力和残余变形。结合试验测试和数值模拟,研究了4种不同焊接顺序对焊接接头残余应力分布和残余变形的影响。采用ABAQUS软件中的单元生死技术模拟焊接过程,热源模型采用双椭球体积热源。结果表明,数值模拟结果与试验结果相符,改变焊接顺序对温度场影响不大,两侧焊道单次交替焊接相比两侧焊道多次交替
期刊
<正>3月7日,工信部印发《车联网网络安全和数据安全标准体系建设指南》,以下简称《指南》。《指南》对基本原则、主要目标、主要内容和组织实施做了规定。基本原则:需求导向、共同推进;聚焦重点、急用先行;开放融合、深化合作。
期刊
报纸