EDAG/p300/GATA1复合体作用机制研究

来源 :北京工业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:yeyennn
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
红系分化相关基因(Erythroid Differentiation-Associated Gene, EDAG)是造血组织特异表达的转录调节因子,参与调控造血细胞的增殖、分化和凋亡,在造血谱系分化平衡的过程中发挥关键作用,但其作用机制并不明确。本论文以蛋白质复合体为切入点,发现EDAG在造血细胞中可形成两个独立的复合体:EDAG/p300/GATA1及EDAG/Hsp70/GATA1,同时对EDAG/p300/GATA1复合体的作用机制进行了深入研究。本研究中,我们首先在K562细胞中证实EDAG在生理条件下可与多种蛋白质存在相互作用。利用连续免疫清除的方法验证了EDAG/p300/GATA1和EDAG/Hsp70/GATA1能分别形成两个独立的复合体。进一步明确了EDAG与GATA1相互作用的结构域位于N端,与p300相互作用结构域位于C端,证实EDAG可增强p300与GATA1相互作用并增强p300对GATA1的乙酰化修饰,进而增强GATA1转录活性及靶基因表达。在EPO诱导CD34~+细胞向红系分化过程中,EDAG和GATA1的蛋白水平上调, EDAG/p300/GATA1形成复合体。通过染色体免疫沉淀实验表明,EDAG与GATA1共结合在GATA1靶基因调控区,选择性调控GATA1下游靶基因的表达。这些结果提示EDAG/p300/GATA1复合体在红系分化过程中发挥重要作用。此外,对EDAG/Hsp70/GATA1复合体进行初步研究发现,在EPO诱导CD34~+细胞向红系分化过程中,过表达EDAG能促进Hsp70入核,保护GATA1免受Caspase-3的切割,促进红系分化。为进一步揭示EDAG在造血中的作用机制,我们利用ChIP-seq分析了EDAG在EPO诱导CD34~+细胞中的全基因组结合谱。利用染色质免疫共沉淀成功富集了CD34~+细胞中的EDAG蛋白质和染色体DNA。将富集到的DNA样品进行高通量测序和生物信息学分析,共得到1292个EDAG结合位点的Peaks数目,代表了975个结合的基因。我们进一步利用QPCR对ChIP-Seq数据进行了验证,证实EDAG可结合在检测的靶基因调控区上。将ChIP-seq获得的EDAG结合的基因与基因表达谱进行整合,结果表明两种数据共同覆盖161个基因,其中36个基因上调,126个基因下调,提示这161个基因是EDAG直接调控的靶基因。将EDAG结合的基因进行基因功能(Gene ontology, GO)注释,表明EDAG参与了细胞周期、细胞生长、细胞分化、细胞凋亡及信号通路等多种生物学过程。进一步将EDAG结合的基因群与GATA1结合的靶基因群进行整合,发现共有230个基因是由它们共同调控,并且在部分基因的调控区两者存在共结合,提示在红系分化过程中EDAG与GATA1可形成复合体实现对靶基因的选择性调控。综上,本研究发现EDAG可与GATA1、p300形成复合体,通过C端募集p300使N端结合的GATA1乙酰化增强,进而增强GATA1的转录活性。EDAG与GATA1共结合在GATA1靶基因调控区,选择性调控GATA1下游靶基因的表达。同时利用ChIP-Seq技术鉴定了红系分化中EDAG在染色体上的结合谱,对数据分析发现EDAG直接调控的靶基因,为揭示EDAG作用机制提供了功能线索。
其他文献
新时期,在互联网科技的强势推动下,微博微信等信息传播平台层出不穷,不仅在媒体界掀起一股热潮,而且也使得人们的生活方式发生翻新的变革。新媒体的迅速发展致使传媒媒体遭受
<正>2018年11月5日,习近平总书记在首届中国国际进口博览会上宣布,将在上海证券交易所设立科创板并试点注册制。我国新股发行体制积弊已久,注册制改革恰逢其时,对资本市场发
运用遥感技术提取居民点数据,以人口数量比重划分汉族、白族、彝族和傈僳族聚落,采用景观格局指数、最邻近分析、核密度分析等定量化方法分析聚落斑块、空间形态、空间分布和
排球作为一种当下最常见、最流行的球类运动,已经深受众多青少年的喜爱和追捧。而在高校的体育教学科目中,排球也成为了一项重要的训练课程。有效地提高排球队员在排球训练中
贝多芬的作品大多数带有丰富的浪漫主义色彩,能够通过创作某一旋律来反映其心理情感及哲学思想。《月光奏鸣曲》是贝多芬代表作品之一,以其细腻的情感、充实的内容、创造性的
《高聚物近代研究技术》课程是应用型本科院校高分子材料与工程专业的必修课,是培养和提高学生的综合分析问题的能力、实践和创新能力必须的、不可缺少的一门专业课,在培养高
中国电视综艺节目度过了大量购买国外版权时期,目前正在开辟出一条属于自己的道路。作为中国新型原创电视综艺节目的代表,《演员的诞生》有诸多模式创新之处。本文从传播学角
鲁冰是中国当代童话作家,曾获第十六届冰心儿童文学奖。他的童话字里行间处处透着冰心老人的“爱的哲学”的气息——讴歌母爱、咏叹童心、礼赞自然,不仅为儿童建构起了一个理想
随着全球工农业的迅猛发展,土壤污染问题越来越突出,且污染物种类日趋多元化和复杂化。目前,重金属和有机物复合污染土壤问题已受到社会各界的关注,重金属移动性强,易被植物