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柑橘是我国第一大水果,现阶段,我国柑橘产业结构仍需要进行改进,突出的问题主要表现在晚熟加工品种稀缺,鲜食品种供应期集中。本研究鉴定的两个变异材料能够填补目前市场上的空白,为我国柑橘品种的改良起到重要作用。本研究以在兴山发现的晚熟锦橙[Citrus sinensis (L.) Osbeck]变异和在秭归发现的适合鲜食的伏令夏橙[Citrus sinensis (L.) Osbeck]变异为材料,使用AFLP分子标记技术对变异材料及其母本进行遗传鉴定,鉴定出变异与母本的差异。对果实的常规品质进行分析的结果显示：晚熟锦橙变异的果实品质与母本变化不大,其加工品质无变化,伏令夏橙变异果实表现为无籽,固酸比高等性状,具有作为鲜食品种推广的潜力。具体研究结果如下：1.使用流式细胞仪对伏令夏橙变异和母本进行倍性鉴定,结果表明变异和母本都是二倍体。使用了120组AFLP引物组合在晚熟锦橙变异及其母本中鉴定出16条多态性条带；在伏令夏橙变异及其母本中鉴定出2条多态性条带。将鉴定出的多态性条带测序,根据序列比对的结果设计引物,设计的部分引物在两组变异和母本材料中能够扩增出来,说明变异材料是不同于母本的芽变新种质,能够作为品种资源加以利用。2.晚熟锦橙果实的常规品质和母本变化不大,主要的加工品质中,出汁率为59.74%,可溶性固形物(TSS)含量为11.27%,可滴定酸(TA)含量为1.19%,Vc含量为52.55mg/100g,满足加工品种的品质要求。气相色谱(GC)分析果实中可溶性糖酸含量也无较大差异。伏令夏橙变异果实大小(纵径8.82cm,横径8.65cm)较母本大,同时表现无籽,固酸比高(14.84)等特性。GC分析显示伏令夏橙变异果实苹果酸(0.71mg/g)和蔗糖含量(43.11mg/g)显著高于母本,柠檬酸含量(3.02mg/g)显著低于母本,其他种类可溶性糖酸无显著差异,从而构成变异单株果实的风味特点,有可能成为鲜食品种加以推广。