鲫鱼PKR-like基因的鉴定及其特征分析

来源 :中国科学院水生生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ddp100
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在脊椎动物中,作为抗病毒入侵的第一道防线,干扰素主要诱导一系列的抗病毒蛋白来发挥抗病毒作用,其中包括双链RNA(dsRNA)激活的蛋白激酶PKR.此外,PKR在调控细胞凋亡、细胞分裂和分化中也发挥重要作用.本研究利用紫外线灭活的草鱼出血病病毒(GCHV)感染的、产生干扰素的鲫鱼囊胚培养细胞(CAB)系统,克隆了第一个鱼类类PKR基因(Carassius auratus PKR-like,CaPKR-like).CaPKR-like全长cDNA序列为2192bp,其最大阅读框(ORF)编码一个由513个氨基酸组成的蛋白.同源性分析显示CaPKR-like与eIF2α激酶家族的PKR亚家族有最大同源性.系统树分析也表明CaPKR-like与哺乳类PKR有共同的进化起源.结构上,CaPKR-like蛋白的C-端包含与哺乳动物PKR高度同源的激酶催化区,但在N-端却没有哺乳类PKR保守的dsRNA结合区(dsRBMs),取而代之的是2个Zα结构域(Z-DNA binding domains),Zα1和Zα2.
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