宁夏回汉族人群五个易感区域单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂的关联研究

来源 :宁夏医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:harvy_chen
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目的唇腭裂是人类最常见的一种出生缺陷,世界范围内统计的发病率约为1.67/1000。根据全身是否伴发其他畸形,唇腭裂可以分为非综合征型唇裂伴或不伴腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)和综合征型唇腭裂(syndromic cleft of lip with or without palate,SCL/P)。NSCL/P多被学界认为是一种多基因遗传病,由遗传和环境因素相互作用共同引起,具有显著的遗传异质性。其遗传异质性表现在不同种族群体中其患病率也有所不同。国内外陆续报道了10多个与NSCL/P有关的候选易感基因和位点,其中1q32(IRF6),1p36.3(MTHFR),1q22-1q24(SKI),2p13(TGFA),2q33(SUMO1),4p16(MSX1),6p23-25(F13A,HGP22、AP2),11q23-q24(PVRL1),14q24(TGFB3),17q21(RARA),19q13(BCL3,TGFB1)等,这些基因的相关位点得到了较多研究的支持。近期,在唇腭裂遗传病因学研究方面,出现了4个全基因组关联研究(genome-wideassociation studies,GWAS),揭示出了5个新的NSCL/P易感区域。本研究即选取这5个易感区域的代表性单核苷酸多态位点[8q24.21(rs987525),20q12(rs13041247),17q22(rs227731),10q25.3(rs7078160)和1p22.1(rs560426)]在中国宁夏地区回汉族人群中验证它们与非综合征型唇腭裂的相关性。方法收集了病例组非综合征型唇腭裂患儿372例,其中汉族191例,回族181例,患儿父亲205例,母亲240例,完整3人核心家系158个。对照组收集在校正常大学生498例,其中汉族281例,回族217例。分别采用TaqMan基因型鉴定(TaqMan SNPsgenotying)技术和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chainreaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的技术检测这5个SNPs的基因型,进行病例对照分析,传递不平衡检验(TDT)和以家系为基础的相关性分析(FBAT)。结果染色体20q12区域的rs13041247位点在本研究人群的单纯唇裂组及唇裂伴或不伴腭裂组中基因型与等位基因频率与对照组比较存在统计学差异(P=0.02,P=0.04,P=0.01,P=0.04),而在单纯腭裂组中不存在统计学差异(P=0.25,P=0.51)。染色体17q22区段的rs227731位点在汉族唇裂组和唇裂伴或不伴腭裂组中等位基因频率与相应对照组比较存在统计学差异(P<0.05),在汉族单纯腭裂组和唇腭裂组及回族所有分组中与相应对照组比较无统计学意义(P>0.05),在回汉族唇腭裂组等位基因和唇裂伴或不伴腭裂组基因型,等位基因比较均存在统计学差异(P=0.04,P=0.04,P=0.01);1p22.1区段的rs560426位点在汉族唇裂组和唇裂伴或不伴腭裂组中基因型与等位基因频率与相应对照组比较存在统计学差异(P<0.05),在汉族单纯腭裂组和唇腭裂组及回族所有分组中与相应对照组比较无统计学意义(P>0.05),在回汉族单纯唇裂组基因型,等位基因比较存在统计学差异(P=0.04,P=0.01);染色体10q25.3区段的rs7078160位点和染色体8q24区域的rs987525位点基因型与等位基因频率与对照组比较及回汉族相互比较均不存在统计学差异(P<0.05)。传递不平衡研究发现rs13041247位点C等位基因在单纯唇裂组中存在过传递(P=0.03)。结论在宁夏人群中染色体20q12区段的rs13041247位点与非综合征型唇腭裂有关联。在宁夏汉族人群中染色体17q22区段的rs227731位点和1p22.1区段的rs560426位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂有关联。染色体10q25.3区段的rs7078160位点及染色体8q24区段的rs987525位点与非综合征型唇腭裂无关联。
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