目前我国食用菌主要以家庭为生产单位,以手工生产为主要生产方式,属于劳动密集型产业。零星分散的小农生产,使食用菌产业抵御风险的能力较低。而工厂化生产是降低成本和提高产量的有效途径,同时也是食用菌产业未来的发展趋势,可以给食用菌产业发展注入新的活力。工厂化生产可以实现食用菌周年化生产,缓解散养户季节性生产造成的食用菌阶段性供应不足的问题,保持食用菌产业持续稳定的发展。但是,食用菌工厂化生产投入成本过高,如何提高食用菌工厂化生产的生产收益和生产绩效是食用菌产业未来发展所要解决的重要问题。本文在对山东省食用菌主产区的生产农户和工厂化生产企业进行实地调研并收集相关调查问卷后,基于调研数据,对食用菌工厂化和农户生产的生产成本收益进行比较分析,研究发现:调研的41个食用菌工厂化生产企业中,平均生产成本由低到高依次为平菇、金针菇、杏鲍菇和双孢菇。从收益情况看,双孢菇工厂化生产的平均收益最好,其次为杏鲍菇和金针菇,平菇的工厂化生产平均收益状况较其他三种食用菌差。相比较而言,平菇在工厂化生产和农户生产的两种生产模式下的生产绩效都较好,但更适宜农户进行生产,金针菇在两种模式下的绩效水平相差较大,在当前市场和环保政策的约束下更适宜于进行工厂化大规模生产。采用多元线性回归模型对食用菌种植农户和工厂化生产的生产收益影响因素进行分析,发现食用菌生产企业和农户净收益水平均受到食用菌销售价格、食用菌年产量、原材料成本和固定资产成本的影响。采用DEA模型对两种生产模式下的生产效率进行比较分析,研究发现食用菌生产企业的技术效率、纯技术效率和规模效率均值都要高于食用菌生产农户,并且生产经营规模相对于食用菌生产农户更优。食用菌工厂化生产的生产效率受到机械化程度、生产管理水平、加工产品种类和生产年限的影响。