多重耐药鲍曼不动杆菌的全基因组测序及生物信息学分析

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鲍曼不动杆菌是一种需氧的、非发酵糖类的、无动力的革兰氏阴性杆菌。作为一种临床上重要的条件致病菌,鲍曼不动杆菌能够引起包括肺炎、脑膜炎、尿路感染和血液感染在内的多种院内感染。鲍曼不动杆菌具有快速获得多重耐药的能力因而很难治疗并导致很高的致死率,因此掌握鲍曼不动杆菌的耐药机制和流行病学对于指导临床合理使用抗生素具有重要意义。焦磷酸测序技术以其高通量、性价比高等特点在鲍曼不动杆菌的全基因组测序和揭示鲍曼不动杆菌的耐药机制中得到广泛应用。本研究中鲍曼不动杆菌MDR-TJ菌株分离自天津医科大学第二附属医院,对青霉素、头孢菌素、氨基糖苷类、喹诺酮类、亚胺培南耐药,属于多重耐药菌株,通过罗氏454GS FLX Titanium对其进行全基因组测序发现,鲍曼不动杆菌MDR-TJ的基因组由一条3,964,912bp的环状的染色体和两个环状质粒组成,质粒的大小分别为77,528bp和110,967bp。MDR-TJ菌株的染色体的GC含量为39.1%,编码3,827个基因,质粒pABTJ1编码109个基因,碳青霉烯水解酶基因OXA-23由转座子Tn2009携带并且也位于质粒pABTJ1上,质粒pABTJ2的GC含量为41.6%,编码124个基因,携带有大量的噬菌体蛋白编码基因和一个tRNA基因。通过多位点序列分型(MLST)确定MDR-TJ菌株属于欧洲克隆II型,鲍曼不动杆菌杆菌MDR-TJ的ATP酶基因comM中插入了一个耐药基因组岛并命名为AbaR25,AbaR25主要由两个拷贝的转座子Tn6022构成,含有四环素、链霉素、磺胺类的耐药基因,AbaR25与欧洲克隆I型中的耐药基因组岛的结构明显不同,通过分析目前仅有的7个来自欧洲克隆II型鲍曼不动杆菌的耐药基因组岛发现转座子Tn6022经常插入到欧洲克隆II型的comM基因。
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