尼日利亚位于恐怖主义泛滥的萨赫勒地带，因其国内复杂的政治、经济、宗教等原因，使得极端恐怖组织博科圣地在该国诞生。该组织自成立以来频繁在尼日利亚东北部地区发动恐怖袭击，对包括尼日利亚、乍得、喀麦隆、尼日尔在内的多个国家构成了严重的安全威胁。对此，尼日利亚政府采取了一系列治理措施。政治上利用谈判分化瓦解博科圣地、治理腐败问题来切断博科圣地的资金来源;经济上发展农业解决温饱和就业问题，改善投资环境促进尼日利亚经济的恢复，以清除恐怖主义滋生的土壤;军事上对博科圣地采取了强硬的打击措施，除尼日利亚安全部队外，尼日利亚还与受博科圣地影响严重的周边四国组成了8700人多国联合特遣部队在尼日利亚境内对博科圣地的恐怖分子开展军事清剿行动，积极构建多边安全合作机制乍得湖流域委员会。国际层面上尼日利亚加强了与联合国和美国、英国等域外国家的双边和多边安全合作。
　　近年来，局部地区的军事清剿行动进展顺利，收复了被博科圣地占领的尼东北部大部分领土，因恐怖活动的死亡人数大大减少。虽然，但从整体的治理效果来看，还存在很大的不足和提升空间。首先尼日利亚政府对恐怖分子和平民采取无差别的军事打击策略，进一步加深了政府与普通民众的矛盾;其次政府官员与博科圣地的相互勾结导致反恐效率低下;再次在反恐机制构建上，联邦政府和州政府未能融合政治分歧;第四尼日利亚经济发展水平低下使得反恐意愿与反恐能力脱节，第五尼日利亚政府文化反恐措施滞后，无法有效地遏制宗教极端思想的传播;最后由于缺乏合作共识，使得多国联合特遣部队相互之间的配合度较低。
　　面对反恐进程中存在的困境，一方面尼日利亚作为反恐合作的发起者，应尽快提高自身的治理能力。从农业着手发展经济，解决贫困、饥饿和就业问题;打击政治腐败，减小州政府与联邦政府的政治分歧;重视教育对人的开化作用，落实宗教去极端化政策;加强警察队伍的建设，提高军事反恐实力。另一方面尼日利亚要善于利用现存的乍得湖流域委员会这一区域性合作机制，多与其他国家展开对话和交流，进一步淡化成员国内部的矛盾和分歧，让地区认同的理念深入人心，进而有效地规避安全风险。