军工企业是国民经济的重要组成部分，在推动科技进步方面有着不可替代的作用，而今现代科技的重大创新越来越依赖于先进的科学方法。要推动我国军工企业创新，需要有意识地推广和应用创新方法。本研究在深入分析我国军工企业创新方法应用现状基础上，借助创新扩散理论、系统理论、集成及知识管理等，分析我国军工企业创新中存在的问题，并在此基础上探索了一套完整的创新方法在军工企业应用的运行机制，从组织机制、培训机制、绩效考评机制、激励与约束机制四方面进行研究设计，使军工企业创新方法的应用进一步优化、流程更加规范，从而提升军工企业创新效率，完善创新体制。组织机制方面，本文构建了军工企业创新方法推广应用的组织体系，分别从集团总部层面、军工企业内部层面和创新专业团队层面，构建军工企业创新方法推广应用的组织体系和协同机制。培训机制方面，建立军工企业内部创新方法培训体系并构建以案例库为基础的创新方法学习应用平台，以进一步促进创新方法在军工企业内部的推广应用。绩效评价机制方面，采用数据包络分析方法，构建军工企业创新方法应用绩效评价的指标体系和量化分析模型，实现对创新方法推广应用绩效的定量评价。激励约束机制方面，分别从定量化的模型分析探讨企业具体资源要素的投入情况，以及定性化的综合配套应用形成群体组织管理措施。