伴随着我国社会高速发展,经济体制的转型升级,以及新公共管理运动的理念对我国政府改革产生的影响,人们已经越来越意识到政府部门绩效评价的重要性。多年来,国内外学者对如何科学评价政府部门绩效做出了深入的研究,并已在政府运行过程中进行了大量的实践探索。海关作为国家对货物进出关境的监督管理机构也经历着从过去的执法为主,到现在既要“把关”也要“服务”的过程。从税收征管的角度来看,过去海关主要关注的是税收量的多少,而现在科学合理征税对促进我国外贸发展、优化国内经济环境的作用越来越被大家所认同。利用绩效评估来指挥和引导海关税收工作的科学合理、可持续发展是一种非常有效的方式。在海关工作中开展绩效评价不仅是政府职能转变的要求,更是海关自身发展的迫切需要。通过对绩效评价相关理论和平衡计分卡相关理论的研究,将海关税收工作作为切入点,以上海外高桥保税区海关为例,针对现有税收绩效评价体系的不足之处,论述了在税收绩效评价中引入平衡计分卡的可行性和重要意义。并运用平衡计分卡的先进理念,首先确定了外高桥保税区海关税收工作的使命、价值观、愿景、战略;然后从税收、纳税人、内部业务流程、成长与学习四个维度着手,科学选取评价指标;接着利用层次分析法对各指标在评价体系中的权重予以定量分析;最终构建起一套基于平衡计分卡的外高桥保税区海关税收工作绩效评估指标体系。希望可以针对上海外高桥保税区的特点,就如何科学合理的开展海关税收征管工作做出理论上有益的探索。