Lnc-11的鉴定及其在肝癌中的表达及功能研究

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目的:  肝癌的发生和发展是一个多因素参与的复杂的调控过程。从一定意义上来说,其发生是正常细胞内的重要调控基因失常的导致的最终结果。从分子水平找出肝癌特异性肿瘤标志物,为检测肝癌的发生发展和预后,针对性的进行靶向治疗具有重要的临床应用价值。  长链非编码RNAs(LncRNAs)一般是指大于200个核苷酸(nucleotide,nt)的非编码RNA。近年来的研究表明,它们在胚胎发育和细胞分化中都起着重要作用,具有极其复杂而重要的生物学功能。越来越多的研究结果显示LncRNA在肿瘤的发生发展中发挥了重要的作用,但相对于编码基因,非编码RNA在肿瘤中的研究还处于起步阶段。寻找到肿瘤特异的长非编码RNA,揭示它在肿瘤中的功能对阐明肿瘤的发病机制,发现潜在的诊断和治疗靶点很有意义。  方法:  本研究分为四个部分:  1.验证Lnc-11在肝癌组织标本中表达水平:通过QRT-PCR技术检测Lnc-11在肝癌组织与正常肝组织中的表达水平,对前期实验用芯片检测出的Lnc-11在肿瘤中的表达水平进行验证。  2.Lnc-11起止序列的鉴定:通过RACE技术扩增出Lnc-11的5端和3端序列,并将RACE产物与pGEM(@)-T Easy载体的连接,EcoR1酶切鉴定阳性克隆,然后进行基因测序鉴定,最后比对数据库中的序列确定Lnc-11的起止系列。  3.Lnc-11过表达质粒的构建:依据RACE技术鉴定出Lnc-11的5端和3端序列,设计引物扩增Lnc-11的全长序列,并引入用BamHⅠ和XholⅠ酶切位点,对Lnc-11的PCR产物和pcDNATM3.1(+)和pcDNATM3.1(-)质粒双酶切后分别进行连接,构建pcDNATM3.1(+)-Lnc11和pcDNArM3.1(-)-Lnc11重组质粒,测序鉴定。  4.Lnc-11对肝癌细胞的迁徙和增殖能力的影响:通过转染Lnc-11的重组质粒,上调肝癌细胞中Lnc-11的表达水平,并通过QRT-PCR检测转染细胞过表达的效率;进一步通过划痕修复、Transwell迁移实验和增殖实验,揭示Lnc-11的功能。  结果:  1.通过QRT-PCR技术对43对肝癌组织及相应的癌旁组织中Lnc-11的表达水平进行检测,结果显示,相对于正常肝组织Lnc-11在肝癌组织中表达水平显著下调,与芯片结果相符。  2.通过RACE技术扩增出Lnc-11的5端和3端序列,经过琼脂糖凝胶电泳鉴定,分别得到约500bp和400bp大小的片段。经过胶回收、连接pGEM(@)-T Easy载体,酶切鉴定,阳性克隆送基因公司测序。测序结果显示5端序列与数据库中注释的序列一致,3序列较数据库中注释的序列少约100bp。  3.依据RACE技术鉴定出Lnc-11的5端和3端序列,设计引物扩增Lnc-11的全长序列,得到约1700bp的片段,连接于pcDNATM3.1(+)和pcDNATM3.1(-)质粒,构建pcDNATM3.1(+)-Lnc11和pcDNATM3.1(-)-Lnc11重组质粒经酶切鉴定后经DNA测序证实其序列以及插入方向正确。  4.在肝癌细胞中转染Lnc-11的重组质粒,QRT-PCR验证Lnc-11的表达水平上调约300倍;转染24小时候进行功能实验,划痕实验的结果显示,转染Lnc-11的重组质粒的细胞,较转染空载体的细胞和转染Lnc-11反义序列的重组质粒的细胞爬行的能力显著将降低;Traswell迁移实验的结果显示,转染Lnc-11的重组质粒的细胞较两组对照细胞迁移的能力显著下降;而增殖实验的结果显示,Lnc11对肝癌细胞的增殖能力无显著影响。  结论:  与正常肝组织相比Lnc-11在肝癌组织标本中表达量显著下调,与前期非编码RNA芯片所得结果相符;并通过RACE技术鉴定出Lnc-11的5和3序列,并成功扩增出Lnc-11的全长序列,并构建pcDNATM3.1(+)-Lnc11和pcDNATM3.1(-)-Lnc11重组质粒;通过转染Lnc-11的重组质粒,上调肝癌细胞中Lnc-11的表达水平,发现Lnc-11能够显著促进肝癌细胞迁移能力,而对肝癌细胞的增值能力无显著影响。
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