熔解曲线法用于脓肿分枝杆菌种鉴定和克拉霉素耐药检测

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目的
  分析脓肿分枝杆菌复合群(MABC)对14种药物的敏感性:探究脓肿分枝杆菌复合群对克拉霉素的耐药机制;建立一种鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌的方法;建立一种检测脓肿分枝杆菌复合群克拉霉素的耐药相关基因突变的方法,为临床脓肿分枝杆菌复合群感染的快速诊断和有效的治疗提供新的技术手段。
  方法
  1、对2005-2012年收集自湖南、安徽、江西和福建的83株脓肿分枝杆菌和56株马赛分枝杆菌采用微孔板显色法检测其对14种药物的最低抑菌浓度(MIC)。
  2、对药敏试验延长培养时间至14天,观察脓肿分枝杆菌复合群对克拉霉素的初始耐药和诱导耐药情况,对相关耐药基因rrl和erm(41)测序,分析其基因型与耐药表型的关系。
  3、建立一种SYBRgreen熔解曲线法鉴别脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌,并用临床株评估其灵敏度和特异度。
  4、建立一种mTaq熔解曲线法检测脓肿分枝杆菌复合群对克拉霉素耐药相关基因突变。
  结果
  1、脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌对以下药物耐药率均较低:替加环素、头孢西丁、克拉霉素和阿米卡星,耐药率分别为0%、2.4%、2.4%、3.6%和0%、3.6%、8.9%、0%,差异无统计学意义(P>0.05)。耐药率都较高的有甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、环丙沙星、莫西沙星、多西环素、阿莫西林/克拉维酸、头孢曲松和妥布霉素,其耐药率分别为94.0%、94.0%、90.4%、95.2%、100%、100%、86.7%和94.6%、94.6%、85.7%、96.4%、100%、100%、87.5%,差异无统计学意义(P>0.05)。与脓肿分枝杆菌相比,马赛分枝杆菌耐药率更低的药物有利奈唑胺(47.0%和16.1%)、亚胺培南(38.6%和17.9%)和米诺环素(94.0%和82.1%),差异具有统计学意义(P<0.05)。
  2、83株脓肿分枝杆菌中,2株克拉霉素初始耐药,占2.4%;62株诱导耐药,占74.7%;19株敏感株,占22.9%。56株马赛分枝杆菌中,5株克拉霉素耐药,占8.9%;51株敏感,占91.1%;无诱导耐药。对克拉霉素耐药相关基因检测结果显示:所有的脓肿分枝杆菌均有全长的erm(41)基因,并且所有的马赛分枝杆菌erm(41)基因均有2个片段缺失。83株脓肿分枝杆菌中有67株为T28型,16株为C28型;马赛分枝杆菌均为T28型。脓肿分枝杆菌T28型与克拉霉素诱导耐药具有强相关性,C28型指示无诱导耐药。2株脓肿分枝杆菌和5株马赛分枝杆菌克拉霉素初始耐药株均发生了rrl基因2058/2059位点突变。
  3、SYBRgreen熔解曲线法检测脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌标准株的灵敏度为100fg/μL,对模拟样本的最低检测下限为10cells/μL。对139株脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌临床株进行熔解曲线分析,可以有效将二者鉴别。用11种分枝杆菌和常见的10种呼吸道菌共86株菌进行特异度检验,均未发现非特异性扩增,特异度为100%。
  4、mTaq熔解曲线方法对139株脓肿分枝杆菌复合群临床株鉴定结果显示rrl基因有7株发生变异,132株为野生型,与测序结果符合度为100%。83株脓肿分枝杆菌中有67株erm(41)基因为T28型,16株为C28型,56株马赛分枝杆菌均为T28型。与药物敏感性试验结果(69株耐药、70株敏感)相比,该方法的敏感度为100%(69/69),特异度为95.7%(67/70)。
  结论
  脓肿分枝杆菌和马赛分枝杆菌对多数药物耐药率都较高,尤其脓肿分枝杆菌对克拉霉素诱导耐药现象,导致治疗困难。SYBRgreen和mTaq熔解曲线方法可以快速准确的进行脓肿分枝杆菌复合群种鉴定和检测克拉霉素耐药性,对于脓肿分枝杆菌复合群感染诊断和治疗有重要意义。
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