现代法治社会,教育的发展应以民主、法治为导向。在我国高等教育改革中高等学校成为改革的重心。在以高等学校为主体形成的各种法律关系中大学自治权的性质是权力亦或权利,是一个棘手的难题。本文的研究试图回溯这个难题,本文大体分为四个部分：一是大学自治权的历史考察。在概述大学自治源于欧洲中世纪城市自治和行会自治的基础上,介绍了大学自治权的内容包括司法裁判,免除赋税和兵役,罢教和迁移等权利。论证了当代西方大学自治变革的原因和形式,指出美国大学是当代大学自治的标志。在界定西方“大学自治”与我国“办学自主权”概念异同的基础上,追溯我国大学自治的历史轨迹,指出两者都赋予大学以法人地位,尊重其办学自主不受外部干预的权利,提出“办学自主权”即是我国大学自治权。二是大学自治权的理论纷争。国内学术界对大学自治权的法律性质可谓观点纷呈,争辩激烈。“公权力说”认为大学具有行政主体地位。该观点内部又分为“法律法规授权组织说”和“公务法人说”。“私权利说”主张以民事法律关系来处理高等学校与教师、学生之间的关系,认为高校履行的行政是私人行政而不是公共行政。“混合说”主张根据大学与对方当事人的地位不同可划分为公权力和私权利,也有学者提出第三部门的社会权力理论。三是大学自治权的学理解析。权利与权力是法律上的相对的基本范畴,两者在来源、运行方式、本质特征和监督机制上存在着本质区别。由于目前学界对我国大学自治权性质的认识较为模糊,保障和规范我国大学自治权的前提在于：从权利与权力的角度解构我国大学自治权的内涵。四是我国大学自治权的完善对策。权利的行使需要立法的保障,权力的运行需要权力的制约。本文最后在分析大学自治权的现实困境及其原因的同时,提出完善我国大学自治权的相应建议。