2010年以来,投资对中国经济增长的贡献率呈现下降趋势,中国国家竞争力发展亟待由投资导向转换为科技创新导向。随着世界经济衰退,逆全球化加剧,中国在全球化进程中所形成的以“引进、消化吸收再创新”为主的国家创新模式运行受阻,中国的科技创新政策也随之发生变化。“把科技自立自强作为国家发展的战略支撑”于2020年提出。科技自立自强需要技术源头可控,创新链完整与否对相应的创新模式运行具有决定性影响。大循环格局下,审视创新链完整性的视域有必要关注区域经济层次。梳理分析国家科技创新模式及政策布局重点,把握国家科技创新发展导向,以1996-2019年国家科技奖励中的生命科学领域、地球与空间科学领域和化学领域的获奖项目为研究对象,据此建立研究数据库。以8年为阶段划分,利用社会网络分析法,测度创新链各环节中政产学研合作网络的整体性特征与主体结构特征。利用标准椭圆差等Arc GIS空间分析技术和可视化技术,对基础研究、应用研究和试验发展环节的科技创新力量空间分布及区域层次创新链完整性进行测度。研究发现,在科技创新合作方面,创新链上主体间整体合作密切度不断提升,对核心主体的依赖程度有下降趋势;高等学校和科研院所在创新链各环节均占据主导地位,企事业在部分环节参与数量较多,但主导性不足。在科技创新力量分布方面,应用研究和试验发展的科技创新力量多分布在胡焕庸线以东地区,北京、上海和江苏是基础研究和应用研究环节中的核心区域,北京、上海、江苏、广东、山东、湖南和四川是试验发展的核心区域。在区域层次创新链完整性方面,东部地区的创新链完整性较高,多通过“自下而上”方式成功补足创新链,中部和西部地区的创新链完整性较低、补足能力较弱。由此可以看出,以上三个方面存在明显缺陷:企事业在科技创新合作中主导作用不强,地区资源禀赋尚未得到充分发挥,市场化程度制约了地区科技创新发展。籍此,提出加强企业创新能力建设,以产业分工转移增强科技创新能力,提升中西部地区市场化程度,立足短板提高创新链效能,加强中央与地方政府科技创新政策联通等提升国家及区域创新链效能的对策建议。