小麦SPX基因家族鉴定及TaSPX3在磷胁迫调控中的功能分析

来源 :河南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tomzhang155
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本实验室前期利用Affymatrix基因芯片技术筛选出水培条件下受磷胁迫强烈诱导上调表达的基因Ta SPX3,该基因属于磷稳态调控密切相关的植物SPX家族,极有可能在小麦耐低磷机制中发挥重要作用。为进一步阐明该基因的作用机制,本研究从普通小麦品种郑麦9023中克隆了Ta SPX3基因全长c DNA序列,利用生物信息学手段对小麦SPX基因家族进行鉴定和进化分析,利用模式植物拟南芥作为载体构建过表达Ta SPX3植株进行功能分析。主要结果如下:1.小麦SPX基因家族的全基因组鉴定与进化分析本研究利用Ensemble数据库小麦基因组信息和拟南芥数据库以及Pfam数据库信息,使用Hmmer-3.1b2软件进行小麦全基因组SPX基因鉴定和分类,共得到了64个小麦SPX基因,可划分为3个亚家族,分别为SPX亚家族、SPX-EXS亚家族和SPX-MFS亚家族。利用Expasy分析SPX蛋白序列的一系列特征,小麦SPX基因的分子量范围是8281.72~97182.09 k Da;等电点介于5.19~10.17;蛋白质的总平均亲水性介于-0.967~0.201。利用Wolf Psort进行SPX蛋白亚细胞定位预测分析,结果表明12个小麦SPX基因定位在细胞核内,42个小麦SPX基因定位在质粒中,6个定位在细胞质中,仅有较少的定位在叶绿体中,还有2个细胞核与质粒中都存在。其中预测的Ta SPX3-6基因全长789 bp,编码262个氨基酸,等电点为8.91,蛋白分子量为29887.54,总平均亲水性为-0.309,定位在细胞质中,即为本研究目标基因-Ta SPX3基因。通过MEGA软件的Clusta W多序列比对和邻近法,选择相关物种的SPX基因进行进化分析,确认该基因与水稻Os SPX3具有最近的演化关系。这些生物信息学的预测分析可以为阐明Ta SPX3的功能提供理论基础。2.Ta SPX3拟南芥过表达株系的构建本研究克隆得到小麦Ta SPX3基因的全长c DNA序列,利用改造后的带GFP标签的p S1300载体,构建了Ta SPX3过表达重组载体,以农杆菌为媒介通过花絮侵染法转化拟南芥,利用潮霉素抗性筛选及表达检测获得阳性突变植株,经逐代的分子鉴定与自交纯合,得到T3代纯合的转基因植株。3.Ta SPX3过表达拟南芥株系的生理表型检测与基因表达分析野生型拟南芥和过表达拟南芥分别在幼苗期、成株期时进行磷胁迫处理即缺磷、低磷(5μM)、高磷(500μM)处理,观察测定生理指标发现:(1)过表达拟南芥与野生型拟南芥在幼苗期地上部的叶片颜色差别较明显,在拟南芥幼苗期的研究中,缺磷、低磷条件下转基因植株与野生型相比地上部呈现明显的绿色,而野生型则呈现墨绿色;同时转基因植株的侧根与野生型相比数量减少。这表明过表达Ta SPX3在苗期对拟南芥缺磷胁迫生理效应起到了缓解作用。(2)过表达拟南芥与野生型拟南芥在成株期生长过程中具有较大差异,在拟南芥成株期的研究中,低磷、高磷条件下转基因植株地上部几乎都抽穗、开花而野生型大部分没有。在缺磷条件下,转基因与野生型植株都抽穗,但是转基因植株的长势较野生型的好,这表明过表达Ta SPX3可以促进拟南芥在缺磷胁迫下的生长,而在低磷和高磷条件下促进生物量效应不明显,但均促使花期提前。q RT-PCR检测幼苗期、成株期在不同磷条件下Ta SPX3及拟南芥中几个磷调控相关基因(At RNS1、At IPS1、At SPX1、At PAP2、At PAP17和AT4)的表达量,过表达Ta SPX3,对拟南芥磷调控网络中的相关基因的表达存在一定的影响,这些拟南芥中磷胁迫响应基因表达量的改变会直接通过生理表型反应出来。4.过表达拟南芥中Ta SPX3基因的表达定位利用激光共聚焦显微镜观察在正常磷条件下培养7天的转基因植株,该转基因植株中携带Ta SPX3编码蛋白与绿色荧光蛋白(GFP)的融合蛋白,结果显示:Ta SPX3编码蛋白主要集中在根尖分生区的输导组织中,这一定位的具体作用机制尚有待进一步的研究。本实验通过生物信息对小麦Ta SPX家族的全基因组鉴定及蛋白性状预测,明确了Ta SPX3基因的分子特征,利用模式植物拟南芥过表达该基因研究了其生理功能、表达水平和组织定位。研究明确了Ta SPX3在植物减缓缺磷机制中的重要作用,为阐明Ta SPX3的生物学功能研究奠定基础。
其他文献
甜瓜是极热敏性水果典型代表,热加工温度超过58oC就会产生明显“蒸煮南瓜”和“硫化”异味,严重影响产品感官质量和市场接受度,制约了甜瓜深加工产业的发展。当前有研究报道
本文针对英国音乐社会学家伊凡·休伊特提出的音乐的现代性危机及其救治方略.运用中西文化比较的方法展开进一步的论述。文章认为伊凡·休伊特关于音乐“本真性”的诠
随着市场的快速发展,越来越多的大型安防项目及甲方越来越高标准的要求都对安防工程、集成类企业的管理提出了新的挑战。我们看到,虽然一部分有较强实力的安防工程企业申办了
第一部分硼替佐米对激素抵抗或复发ITP患者体内长寿命浆细胞的作用探究研究目的:探究激素抵抗或复发的原发性免疫性血小板减少症(immune thrombocytopenia,ITP)患者骨髓内长
本文提出了轴力在计算压弯组合变形中不能被忽略的观点,并导出了轴力影响的解析式,以及忽略或考虑轴力影响的判别式.
现在对建筑来说,通过使用生态节能技术,整个行业正在积极健康的往绿色建筑方向发展。但是经过对高校建筑学教育现状的分析,很明显在建筑学教育中,生态建筑并没有真正作为知识
利用热分析法(TG/DSC)研究五水硫酸铜(CuSO4·5H2O)的热分解过程,并对其脱水机理及硫酸铜(CuSO4)在高温下分解机理进行探索.研究表明,在升温速率为1℃/min时,CuSO4·5H2O的脱水过程
本文分析现有招生工作的现状, 阐述其利弊, 根据河南应用技术职业学院实际情况开发招生管理系统.本系统采用PHP和MySQL技术.该系统以大数据思想为指导, 采用数据挖掘技术深入
伴随着社会经济的快速发展,能利用可再生能源发电的电动汽车拥有非常大的发展空间。可再生能源发电存在的稳定性、连续性差的问题使得电动汽车蓄电池充电装置工作效率降低且
本文采用企业成本收益分析的基本方法,分析了区域内部资源禀赋与制度因素各自对于企业投资区域选择的影响及二者的相互关系,得出的主要结论是:(1)对于特定的区域而言,资源禀