胃癌组织中蛋白质表达谱的建立及差异表达蛋白质的鉴定

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fancysoul
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的: 胃癌是消化系统比较常见的恶性肿瘤之一,也是全球因癌症引起死亡的第二个主要原因。胃癌的早期诊断及早期治疗对提高胃癌患者的生存率至关重要。随着人类基因组计划的完成,恶性肿瘤的研究进入了后基因组时代。本论文利用蛋白质组学方法,建立分辨率高和重复性好的人胃癌组织及其配对癌旁胃粘膜组织的双向凝胶电泳图谱,识别与鉴定其差异表达的蛋自质,寻找胃癌癌变的相关蛋白质分子。对揭示胃癌癌变机制具有重要的理论和临床意义。 研究方法: 利用固相pH梯度双向凝胶电泳方法分离5例胃中分化管状腺癌及其配对的癌旁组织中的总蛋白质,凝胶经银染显示后,采用ImageMaster图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质,对差异表达的蛋白质点,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix—assisted laser desorption/ionization time—of—flight massspectrometry,MALDI-TOF—MS)进行质谱分析鉴定,得到相应的肽质指纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF),数据库搜索鉴定出差异表达的蛋白质。为了验证蛋白质组学分析结果的可靠性,应用免疫组织化学技术EnVision法对其中的2个差异表达的蛋白质(CK19和HSP70)进行了分析。 研究结果: (1)得到了分辨率高且重复性好的人胃癌组织与配对癌旁胃黏膜组织pH4-7和pH6-11双向凝胶电泳图谱。pH4-7胃癌组织及其配对癌旁胃黏膜组织凝胶的平均蛋白质点数分别为1257±89和1153±86个,平均匹配的点数分别为978±122和944±86个,平均匹配率分别为77.8%和81.9%。pH6-11胃癌组织及其配对癌旁胃黏膜组织凝胶的平均蛋白质点数分别为557±22和624±54个,平均匹配的点数分别为526±18和587±38个,平均匹配率分别为94.4%和94.1%。 (2) 应用PDQIJEST软件分析比较pH4-7凝胶银染2D图谱胃癌和癌旁胃黏膜组织中蛋白质点,在胃癌组织中表达上调的有32个蛋白质点,表达下调的有13个蛋白质点,56个点仅出现于胃癌组织中,而有27个点在胃癌组织中失表达。pH6-11凝胶银染2D图谱中,胃癌组织特异性蛋白有11个,胃癌组织中失表达的蛋白有8个,胃癌组织中表达上调的蛋白质有17个,表达下调的蛋白质有7个。 (3) 选取其中的16个差异蛋白质点进行质谱分析,出现质谱结果的有13个蛋白质点。在初步鉴定的13个差异蛋白质中,在胃癌中表达差异的蛋白质有10个,其中2个仅在胃癌中表达,4个在胃癌中表达上调,4个在胃癌中表达下调,3个在胃癌中表达缺失。 (4) 经质谱分析鉴定表明,有3种蛋白质仅在胃癌组织中表达,它们分别是:tropomyosin 4和HSP70蛋白。在胃癌组织中表达明显上调的蛋白质有Peroxiredoxin 4(PRDX4)、creatine kinase B、keratin 19和MYL9。有4种蛋白质在胃癌组织中表达下调,它们分别是gastric lipase、ATP synthase,H+ transporting,mitochondrial F1 complex.beta polypeptide和PP4-X。 (5) 免疫组化分析显示,CK19在胃癌组织中呈弥漫性强阳性表达,而在癌旁组织中呈局灶性表达、弱阳性或不表达,癌组织强阳性表达高于癌旁组织。HSP70在胃癌组织中阳性表达率为71.4%,而在癌旁胃黏膜组织中呈弱表达或表达阴性,癌组织HSP70蛋白表达明显高于癌旁组织。 结论: (1)通过双向凝胶电泳技术建立了分辨率较高且重复性较好的胃癌和癌旁组织pH4-7和pH6-11蛋白质表达图谱。 (2)鉴定了一些可能与胃癌癌变相关的差异蛋白质,为进一步探讨胃癌发生发展的分子机理奠定了重要基础,为筛选胃癌临床诊断的蛋白标记物和治疗的基因靶点奠定了初步基础。 (3)应用免疫组化技术对蛋白质组学得到的部分结果进行了验证,取得了比较一致的结果,表明蛋白质组学是一种筛选癌变相关分子标志物的有效方法。
其他文献
有些汽车收放音机的集成块损坏后无法找到原配的集成块,使收放音机无法工作。本文介绍维修中的替代方法。供读者参考。 1.三洋FSP401汽车收放音机功放集成块M51102损坏,可用
提出了一种针对MIMO系统的广义误差控制,给出了一般设计原则并在此基础上针对机械手设计了一个控制器.仿真表明,用这种方法设计的系统具有极强的鲁棒性,且能够很方便的应用于实时控制
一、大学语文课在全国范围铺开rn自1980年10月在上海召开“大学语文教学讨论会”,全国有20多所高校参加,这个数同随之迅速扩大,至1986年,据全国大学语文教学研究会统计,已有4
在现阶段火箭和新型导弹发动机大型地面试验系统中,液氧系统主要用于为试验工件提供氧化剂。因发动机推力不断加大,推进剂流量不断增大,对地面试验系统中氧化剂的供给能力要
LED路灯驱动电源市场与LED路灯的发展密切相关。LED路灯驱动电源是构成LED路灯的关键组件之一,一盏LED路灯配置一台LED路灯驱动电源。随着LED各项性能参数的不断提升,应用领
何东是一个很有才气的画家,他受过很好的基本功训练,有着扎实的基本功,艺术的表现若没有很好的基本功,就会画得很漂浮,而他画得很扎实。他表现藏族的风情,不是仅仅猎奇,而是
程文超 1942年生,曾任中国人民银行原黑龙江省分行计划处、稽核处、外汇管理处处长、中国人民银行沈阳分行原哈尔滨监管办处长等职务,现任黑龙江省银行业协会顾问。黑龙江省
科学出版社由中国科学院编译局与30年代创建的有较大影响的龙门联合书局于1954年8月合并成立。1993年8月恢复使用“龙门书局”副牌。2007年4月转制成为科学出版社有限责任公
个性化包装是为了满足多层次消费的需求,也是包装设计发展的一个趋势,通过对色彩、图形、造型、材质及使用方式的实际运用,探讨个性化包装的主要表现形式,合理运用这些设计元
本文介绍了在环境探头SPECT数据采集系统上利用多数字信号处理器技术的几种方案,并在现有的McSPECT系统上对几种方案进行了测试比较。 In this paper, we introduce several schemes of u