海绵共附生微生物种群结构的DGGE指纹分析

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本文采用PCR-DGGE基因指纹技术对我国南海四种海绵:细薄星芒海绵、皱皮软海绵、贪婪掘海绵和澳大利亚厚皮海绵的共附生微生物的种群结构组成以及其中可培养的部分微生物的组成进行研究,目的在于为今后开发利用海绵微生物生产活性物质奠定基础。 为进一步了解海绵微生物组成的详细信息,我们对四种海绵的DGGE图谱上优势性菌群条带进行了割胶回收、分子克隆并测序,最后对测序结果做了系统发育树分析。澳大利亚厚皮海绵中的D10是我们实验中发现的唯一与放线菌序列最相似的条带。通过对四种海绵共附生微生物的原位PCR-DGGE研究,克服了传统培养技术的不足,使我们对海绵共附生微生物的优势种群组成及特点有了比较全面的认识。 最后我们采用PCR-DGGE基因指纹技术比较了海绵原位微生物组成及培养微生物种群组成的变化,并对培养富集的条带进行了克隆测序和系统发育树分析。
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