自然保护区对人类社会的可持续发展具有至关重要的作用。在人类社会快速发展今天,自然保护区的建设工作越来越受到各国的重视。自20世纪80年代以来,海峡两岸自然保护区在建设和发展方面都取得了较大成绩,但双方交流甚少,缺乏相互了解。本文通过搜集和整理现有相关文献资料以及运用比较分析的方法,以保护区内重要类型国家公园为例,同时运用实地调查的方法,总结并分析了中国大陆与中国台湾自然保护区的建设现状、分类体系、管理制度、法律法规,将海峡两岸自然保护区建设与经营管理进行深入比较。海峡两岸自然保护区的管理各有优缺点。中国大陆自1956年创设第一个自然保护区之后,经过50多年的创建和努力,目前已经形成了一个比较完善的保护区体系;中国台湾保护区的建设虽然起步晚——1983年,但发展快。中国大陆自然保护区可以划分为自然生态系统类、野生动物类、自然遗迹类三种保护区类型;中国台湾保护区的划分则主要是以IUCN分类标准为基础的,分为国家公园、自然保留区、野生动物保护区与野生动物重要栖息地与自然保护区。中国大陆自然保护区的总面积虽然可观,但人均占有过少,且保护区内管理部门主要任务不明确,保护区相关法律法规制定散乱,保护区建设经费不足,管理人员业务素质不高。应该在借鉴中国台湾保护区经营主导思想的基础上,结合中国大陆实际情况,提出相应对策解决中国大陆在自然保护区发展中存在的问题:利用广阔的土地面积以及劳动力市场优势发展保护区事业;针对各保护区类别制定相应的法律法规,明确各管理部门的主要任务;建立健全的经费管理机制;提升管理人员的文化和业务素质;加强管理机构的业务针对性;制定以不同管理目标为标准的分类管理法规。