【摘 要】
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象鼻溞(Bosmina)是一类世界广布性的小型枝角类浮游动物。象鼻溞以细菌、浮游植物和有机碎屑为食,同时又是鱼虾的生物饵料,是富营养化水体中优势的浮游动物种类,因此在淡水生态系统中起着重要作用。本研究首先单克隆大量培养脆弱象鼻溞(Bosmina fatalis),采用Illumina Hiseq4000平台进行测序,对其线粒体全基因组组成特点、结构特征等进行分析,并对脆弱象鼻溞系统进化进行了探讨,
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象鼻溞(Bosmina)是一类世界广布性的小型枝角类浮游动物。象鼻溞以细菌、浮游植物和有机碎屑为食,同时又是鱼虾的生物饵料,是富营养化水体中优势的浮游动物种类,因此在淡水生态系统中起着重要作用。本研究首先单克隆大量培养脆弱象鼻溞(Bosmina fatalis),采用Illumina Hiseq4000平台进行测序,对其线粒体全基因组组成特点、结构特征等进行分析,并对脆弱象鼻溞系统进化进行了探讨,以期为脆弱象鼻溞的培养和脆弱象鼻溞的分类、系统进化等提供分子水平依据。探索了脆弱象鼻溞的培养条件。挑取单个雌性脆弱象鼻溞进行单克隆扩大培养,然后分别设置4个食物密度梯度0.05×106、0.1×106、0.2×106、0.4×106cells/mL的蛋白核小球藻和斜生栅藻,在温度25℃,光照强度2000 lux,光周期L:D=13 h:11 h的条件下,培养脆弱象鼻溞。结果显示,相比于蛋白核小球藻,斜生栅藻更适合作为脆弱象鼻溞的培养饵料,喂食密度为0.2×106cells/mL的斜生栅藻,脆弱象鼻溞种群密度和种群增长率最大。对脆弱象鼻溞线粒体全基因组结构进行了分析。采用Illumina Hiseq 4000平台,对扩大培养的单克隆脆弱象鼻溞(1.0 g左右)进行线粒体全基因组测序,结果显示,脆弱象鼻溞线粒体全基因组序列总长度为15209 bp,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),22个转移核糖核酸(tRNA)基因,2个核糖体核糖核酸(rRNA)基因和一个非编码控制区。其中23个基因位于J链,14个基因位于N链。A(腺嘌呤)和T(胸腺嘧啶)的碱基含量之和为69.13%,G(鸟嘌呤)和C(胞嘧啶)的碱基含量之和为30.87%,表现为明显的A+T碱基偏倚性。了解了脆弱象鼻溞在枝角类中的进化关系。在从Genbank中下载了 9条枝角类浮游动物线粒体全基因组序列,发现脆弱象鼻溞线粒体基因组的长度与碱基组成比例,与溞属的5种枝角类浮游动物线粒体基因组接近。采用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建系统进化树,结果显示,脆弱象鼻溞与溞属(Daphnia)动物的亲缘关系比其他枝角类浮游动物更近。本研究为脆弱象鼻溞的种类鉴定、进化等提供了分子生物学数据,也为培养脆弱象鼻溞作为鱼虾开口饵料提供了借鉴。
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