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白蚁作为一种古老的,起源悠久,种类众多且品级分化明显的社会性昆虫,在昆虫分类系统中处于较原始和古老的地位。本论文首次测定了小楹白蚁(Incisitermes minor),新渡户近扭白蚁(Pericapritermes nitobei),古田近扭白蚁(Pericapritermes gutianensis),细颚散白蚁(Reticulitermes leptomandibularis),近黄胸散白蚁(Reticulitermes periflaviceps)和近圆唇散白蚁(Reticulitermes perilabralis)等六种白蚁的线粒体全基因组,并对每种白蚁序列进行了详细的注释与分析。同时,对6种白蚁的线粒体全基因组的碱基组成、氨基酸组成、密码子使用等方面进行了系统地分析,并对其进行了系统发育树的构建与简单的进化关系分析。另外,本研究对已有的14种散白蚁属白蚁(NCBI数据库中11种,实验测得3种)线粒体全基因组数据进行多重序列比对,以期找到Cytb基因中片段可作为DNA条形码应用于散白蚁属白蚁的分子分类鉴定。本论文研究的主要结果如下:(1)完成小楹白蚁、古田近扭白蚁、新渡户近扭白蚁、细颚散白蚁、近黄胸散白蚁和近圆唇散白蚁线粒体全基因组序列的注释分析,其线粒体全长分别为15970bp、15264bp、15224bp、15920bp、15925bp和15926bp。(2)通过对六种白蚁线粒体基因组中各个组分分析,发现同属的白蚁不论在碱基组成、基因间隔区和重叠区、蛋白编码基因起始密码子和终止密码子、RNA基因和控制区都十分相似,而不同属的白蚁在各个方面都具有较为明显的差异。(3)系统发育分析结果为:细颚散白蚁与尖唇散白蚁亲缘关系最近,近黄胸散白蚁与散白蚁属Reticulitermes kanmonensis亲缘关系最近,之后与近圆唇散白蚁汇为一支;古田近扭白蚁和新渡户近扭白蚁亲缘关系最近,之后与其他近扭白蚁属白蚁汇为一支;小楹白蚁与堆沙白蚁属(Cryptotermes secundus)亲缘关系最近。NJ建树结果与ML建树结果类似,进一步探究六种白蚁在各自属水平下与其他白蚁种类之间的亲缘关系。(4)通过多重比对筛选在Cytb基因中获得一段基因片段,作为DNA条形码,使用遗传距离法和系统发育法对Cytb-2DNA条形码片段进行分析。遗传距离法分析结果中,barcoding gap范围在0.008-0.018;系统发育分析法结果中,系统发育树呈现了明显的种群分离现象,两种方法均证实该DNA条形码的可行性。本研究的Cytb-2DNA条形码能准确完成对10个未知种样品的种类鉴定,通过该应用实例,最终认为该Cytb-2片段可以作为DNA条形码对散白蚁属种类进行分子分类鉴定。