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饲料成本占养殖成本的60%~70%,为了解决人们日益增长的需求和人畜争粮的问题,需要对饲养动物的饲料转化效率进行选育,提高产量的同时降低饲料的消耗。而随着选育进程的深入人们发现饲料转化率(FCR)并不能很好的反映饲料效率的遗传背景,因此剩余采食量(RFI)被引入。RFI不仅反映了个体由遗传背景所决定的代谢差异,也校正了试验个体的代谢体重,是国际认可的测定饲料转化效率的首选方法之一。本试验旨在研究绍兴鸭RFI在表型、关键基因表达、多态性以及微生物和代谢物方面的差异,探究RFI对机体生产性能的影响以及相关调控机制。本试验以国家级绍兴鸭保种场核心群300只400日龄绍兴鸭为试验对象,进行为期60天的饲养试验。记录每天个体采食量(FI)、产蛋重、初始体重以及结束体重,根据数据计算RFI并排序,选取排名最高的15只和排名最低的15只编为高剩余采食量(HRFI)组和低剩余采食量(LRFI)组。研究结果发现:1、在表型数据分析中,HRFI组和LRFI组在RFI、FI、料蛋比指标上有显著差异(P<0.05),并且LRFI群体日均采食量比HRFI群体低57.0g,而在体重等指标上无明显差异趋势;在对RFI与其他生产性状相关性的分析中,RFI与FI和料蛋比有显著相关性(P<0.05)。本试验对蛋品质进行了测定,结果发现除蛋黄色泽LRFI组显著低于HRFI组外(P<0.05),其他指标均无显著差异,说明在绍兴鸭上进行RFI选择不会造成产品品质下降的问题;并且我们进行了RFI与蛋品质指标之间的相关性分析,结果表明RFI与蛋品质各指标之间均无显著相关性。2、随后我们对LRFI组和HRFI组绍兴鸭下丘脑CCK、NPY、NPY5R基因、十二指肠CCK和NPY基因的表达量以及采食关键基因CCKAR多态性检测。发现在下丘脑各基因相对表达量中,HRFI组NPY以及NPY5R相对表达量较LRFI组分别高出3.52倍和2.49倍,均达显著水平(P<0.05);而CCK在LRFI组中相对表达量显著高于HRFI组(P<0.05);在十二指肠中LRFI组CCK相对表达量显著高于HRFI组(P<0.05),HRFI组NPY相对表达量比LRFI组高3.3倍达显著水平(P<0.05)。本研究中共发现SNP位点56处,其中C1370T编码氨基酸由天冬氨酸变为天冬酰胺,位点A6347G编码的氨基酸由苏氨酸变为异亮氨酸,位点G6530T编码的氨基酸由谷氨酸转变为天冬氨酸,氨基酸的改变可能会改变编码蛋白的结构。研究结果表明位点A1435T、C6164T、A6347G、G6530T处于Hardy-weinbreg平衡状态,PIC值表明,6个位点均处于中度多态位点。在连锁不平衡分析中位点C1370T与A1435T、A6347G,位点A1393G与A1435T以及位点G6530T与C6164T和A6347G之间均为有意义连锁不平衡。而在各位点对生产性状的分析结果表明,位点A1393G、C1435T、G6530T均与FI、RFI有极显著相关性。3、选取盲肠内容物进行16SrDNA鉴定。结果显示,不同RFI组绍兴鸭群体的盲肠微生物α多样性发生了改变,LRFI群体在Chao1指数和Shannon指数以及Simpson指数均显著高于HRFI群体(P<0.05)。在多个生物学水平上LRFI组与HRFI组也有显著差异,在门水平上两组的代表性菌群均为厚壁菌门、拟杆菌门以及变形菌门,但在LRFI组中厚壁菌门以及蓝藻菌门丰度显著高于HRFI组,而在HRFI组中变形菌门、脱铁杆菌门以及Spirochaetes显著高于LRFI组(P<0.05)。在属水平上,LRFI组与HRFI组共有18个差异菌群,其中LRFI组显著高于HRFI组的菌群有17个,并且绝大多数为厚壁菌门。其中Rikenellaceae家族参与了碳水化合物的降解过程;Eubacterium-coprostanoligenes具有降低胆固醇含量的作用;Lachnoclostridium symbiosum是生产丁酸盐的重要成员等,说明RFI不仅影响肠道菌群的丰度与多样性,并且差异菌群主要为营养物质代谢分解的有益菌,提高了LRFI群体的饲料的转化率。这在一定程度上解释了LRFI群体在采食量降低的情况下,产品品质与质量不变的表现。4、在对不同RFI群体绍兴鸭直肠内容物进行LC-MS处理分析,发现差异代谢物90余种,其中在KEGG中能找到对应代谢途径的有29种。整理发现绝大多数差异代谢物在HRFI组中含量高于LRFI组,且以糖类、脂类、氨基酸类为主,大量研究结果表明糖代谢、脂代谢以及氨基酸代谢有着极为紧密的联系,且直肠为机体消化吸收的末端,对营养物质吸收利用效率低下,HRFI组在直肠中代谢物有如此大量的富集,可能与前肠段吸收转化障碍有关。