活版印刷基因芯片制备系统及相关技术研究

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生物芯片技术是继基因工程(重组DNA技术)、聚合酶链式反应(PCR)之后在分子生物学领域中的又一重大突破。在生物芯片技术中,发展最为成熟,研究最为广泛的是基因芯片技术。基因芯片主要有两种制备方法:点样法和原位合成法,点样法存在着生产成本高、繁琐的实验步骤、较低的集成密度等缺点。原位合成法生产速度较快、实验步骤简单、点阵呈指数递增以及高灵敏度等优点,但是也存在合成序列长度受限,或者合成试剂受到专利保护等问题。从今后大规模、批量化生产及应用前景的角度考虑,利用高度自动化技术平台、批量化原位合成基因芯片是重要的发展方向。因此,发展完善和开发快捷、成本低廉的DNA阵列原位合成技术具有重要意义。本论文在已提出的活版印刷原位合成制备基因芯片新方法的基础上,开展如下几个方面的工作:(1)对于活版印刷原位合成基因芯片自动化系统进行了初步探讨。主要研究和探讨了仪器各系统设计思路,并对前后两种材质模板的精度作了较为详细的统计分析。当将系统的底盘和模板由聚四氟乙烯改换成不锈钢后,由于不锈钢自身较低的延展性使得底盘和模板不易发生形变,提高了仪器的精度。(2)对宫颈癌患者和正常妇女进行了基因组的提取和靶序列扩增;实验对常规的酚/氯仿法加以改进,提取血液的DNA;设计了p53第四外显子的引物,PCR扩增,为后续应用研究打下基础。得到的DNA条带清晰明亮、整齐,质量很好,可直接用于PCR扩增反应。(3)应用柠檬酸钠还原法、柠檬酸钠-鞣酸还原法、抗坏血酸还原法、硼氢化钠还原法制备了13nm的胶体金,以应用于金标银染生物芯片检测,并对不同方法制得的胶体金的粒径大小、分散度、稳定性及形貌进行表征。实验表明,柠檬酸钠-鞣酸还原法制备粒径为13nm的纳米金的过程较简单,制得的胶体金稳定性、分散性好,粒径均匀。采用金标银染检测得到了较好的杂交信号。
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