【摘 要】
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目的:本研究旨在通过探究并验证膝关节OA应力集中区与非集中区软骨的潜在关键基因,进一步了解OA软骨损伤的内在机制。方法:我们在GEO数据库下载了GSE117999的mRNA微阵列数据用以生物信息学分析,筛选得到差异表达基因（筛选标准:adj.P＜0.05,|log2FC|＞1）,随后对差异表达基因进行基因本体（GO）注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,然后构建蛋白质相互作用（P
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目的:本研究旨在通过探究并验证膝关节OA应力集中区与非集中区软骨的潜在关键基因,进一步了解OA软骨损伤的内在机制。方法:我们在GEO数据库下载了GSE117999的mRNA微阵列数据用以生物信息学分析,筛选得到差异表达基因（筛选标准:adj.P＜0.05,|log2FC|＞1）,随后对差异表达基因进行基因本体（GO）注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,然后构建蛋白质相互作用（PPI）网络,通过功能相互作用分析得到9个潜在关键基因。收集汕头市中心医院膝OA患者行全膝关节置换术取出的胫骨平台样本,分别提取应力集中区与非集中区的软骨组织。通过q RT-PCR实验验证潜在关键基因mRNA在应力集中区与非集中区软骨中的相对表达水平。通过Western-Blot实验验证潜在关键基因蛋白在应力集中区与非集中区软骨的相对表达水平。最后综合统计分析潜在关键基因在应力集中区与非集中区软骨中的差异。结果:通过生物信息学分析我们最终得到9个潜在关键基因,分别为CAMP、DEFA3、DEFA4、S100A8、HLA-DQA2、FAM20A、ARGLU1、ANO8、FNBP4。FAM20A。q PCR实验发现在应力集中区软骨中,FAM20A mRNA相对表达量显著高于非应力集中区软骨（P＜0.01）,ARGLU1 mRNA相对表达量显著低于非应力集中区软骨（P＜0.05）,而HLA-DQA2、ANO8、FNBP4mRNA在应力集中区与非集中区软骨中相对表达量无统计学差异（P＞0.05）。WB实验表明与非应力集中区软骨相比,FAM20A蛋白在应力集中区软骨中表达更高（P＜0.05）,ARGLU1蛋白在应力集中区软骨中表达更低（P＜0.05）,而HLA-DQA2、ANO8、FNBP4蛋白在应力集中区与非集中区软骨中表达水平无统计学差异（P＞0.05）。结论:膝关节OA应力集中区与非集中区的软骨组织中相关的基因表达存在差异。FAM20A在膝关节OA应力集中软骨组织中高表达,而ARGLU1在应力集中区软骨组织中低表达,ANO8、FNBP4和HLA-DQA2在膝关节OA应力集中区与非集中区软骨中的表达无明显差异。
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