本论文以历史唯物主义方法论为基本指导,以美国与巴基斯坦两国自1947年巴基斯坦建国以来的军事安全合作历程为历史背景,探讨两国如何在国际社会日益重视非传统安全合作的时代大趋势下,就反对和打击恐怖主义问题进行合作,并试图揭示两国建立反恐联盟背后的的战略动机、在反恐合作中各自所持的反恐安全理念、反恐合作方式的发展演变以及受到何种内外因素的制约等。本论文的主体部分分为五章。第一章主要对与恐怖主义、国际安全合作和国际合作反恐相关的概念进行解析,并介绍了与国际反恐安全合作相关的国际政治理论。本章首先对恐怖主义和国际安全合作的基本问题,即概念、含义和形式等方面进行辨析和探讨。本章论述了新现实主义和新自由主义这两派著名的国际政治理论流派中适用于国际反恐合作的理论内涵,并揭示两大理论流派各自的优势与不足。第二章则为分析美国与巴基斯坦在9·11以来的反恐合作历程提供分析的历史背景知识。本章涉及内容的时间跨度界定在1947年至2000年之间,并根据不同时期的标志性事件划分为三个阶段,即1947年巴基斯坦建国至1979年反苏“圣战”爆发之前,1979年至1989年反苏“圣战”从爆发到结束,1989年反苏“圣战”结束至2001年9·11事件发生前。本章将这段跨度长达50多年的历史时期分为三个阶段,由此揭示美国与巴基斯坦军事安全合作关系由萌芽、发展、逐渐成熟、冷却的曲折过程,并试图分析每一个阶段巴基斯坦社会、政治、经济和宗教方面的情况,为深入了解9·11事件以来的美巴反恐合作提供较为客观的背景信息。第三章和第四章是本文的核心内容。第三章着重介绍2001年至2008年穆沙拉夫执政时期的美巴两国反恐合作的历程。第三章首先对9·11事件给国际安全秩序以及国际安全合作带来的影响进行分析,再分析该事件发生后美国与巴基斯坦建立反恐联盟的原因。本章以伊拉克战争为界分为两个部分,揭示伊拉克战争对两国反恐合作带来的影响,以及在两个阶段中两国如何根据新的安全形势调整安全战略和合作方式等。第四章则介绍2009年扎尔达里民选政府上台至今的美巴反恐合作。本章首先介绍了美国与巴基斯坦在经历政局更迭之后,如何调整国家安全战略并制定新的合作策略,并得出两国在新时期内外障碍因素的限制下的合作“继承”多于“变革”的结论第五章在总结和回顾两国反恐合作历程的基础上,进一步剖析两国合作遇到的内外制约因素,重点分析了巴基斯坦难以彻底根除吉哈德极端分子赖以生存的社会和历史根源,以及美国现实主义外交传统思维共同导致反恐合作面临巨大难题;在分析外部制约因素时,则指出印度、阿富汗、伊朗和伊拉克等国家与美巴两国之间错综复杂的关系对两国反恐合作造成了消极影响。本章还根据对美国和巴基斯坦反恐合作内外限制因素的分析和对未来反恐合作趋势的预测,提出了提升两国反恐合作效果的对策。