非期望产出的存在会对效率评估产生巨大的影响,忽略环境污染的代价计算出的经济效率是不准确和不全面的。本文比较了处理非期望产出问题的相关理论及模型的优缺点,从理论和实证两方面证明SBM模型处理非期望产出的合理性和优点,并用此方法分析了我国区域环境效率状况、差异以及演进规律。结果显示,环境变量的引入明显降低了中国区域平均效率水平,中西部地区对环境变量的引入较东部地区较为敏感,西部地区处于经济发展和环境保护的双重困境。同时,本文采用Tobit面板数据回归分析方法实证考察了经济规模、对外开放程度、市场化程度等因素对省区环境效率的影响效果,发现这些因素对于三大地区的作用机理存在差别,并据此给出了一些政策性建议。本文的研究结论是对当前缺乏一套合理可行的省区环境效率评价标准的有益补充,时值我国经济和环境协调发展的关键时期,本文提出的政策建议将有助于各地区采取切实可行的措施实现经济环境的可持续发展。