创业板是我国资本市场为了解决中小高科技企业融资问题而在2009年10月23日挂牌上市的一个特殊的板块。截至2012年12月31日，我国创业板上市公司已有355家，占深交所上市公司总数的23.05%，表现出极大的成长优势。但因创业板上市公司处于初始阶段，各方面没有得到有效规范，存在很多公司治理和财务治理方面的问题，因此以我国创业板上市公司作为研究对象有着较强的现实意义。与此同时，随着公司治理研究的兴起，财务治理的研究也引起了诸多学者的关注。财务治理效率是财务治理的根本目标，没有对效率的深入研究，就不可能有财务治理理论的真正成熟。我们要保证创业板市场高速运行，效率必然是应该放在首要位置的。所以说任何制度包括公司财务治理结构的设计都不能脱离效率而存在，都应为提高上市公司的效率而服务。财务治理结构是提高财务治理效率的关键。财务治理结构是一套关于如何分配财权的制度安排，可以分为微观层面的财务资本结构和宏观层面的财务组织结构。本文从财务资本结构和财务组织结构两个角度深入分析了我国创业板上市公司财务治理结构的特征和财务治理结构配置所带来的财务治理效率。在理论分析的基础上构建实证模型，运用SPSS统计软件从国泰安数据库中选取创业板上市公司2010-2012年的相关数据进行描述统计和回归分析。研究发现对于我国创业板上市公司而言，低债权比例、低股权集中度、高股权制衡度和有效的审计委员会有着较好的财务治理效率；其次国有股持股能较小程度上提高财务治理效率；另外长期债务比例、董事会和监事会的勤勉性对财务治理效率的提高并不明显。最后本文提出了改善财务治理结构的几点建议：去家族化完善股权结构，使公司决策有效率；合理负债经营，提高上市超募所得资金的使用效率；营造良好的财务组织结构环境，促进创业板上市公司有效率成长。