农业是国民经济的基础,同时又是一种弱质产业,因此大多数国家对农业采取了一系列扶持保护政策,以促进农业稳定健康发展。我国对农业的财政支持一直不足,一度出现粮食连年减产的危险局面。因此,在现有农用资金投入不足的情况下,提高农用资金的使用效率,对填补农业领域对财政农用资金的需求,实现相对规模的扩大有着重要的意义。整个财政农用资金支出的体系庞大,项目众多,其中农业综合开发中的土地治理项目对保障我国的粮食安全有着极为重要的意义。我国土地治理项目投入主要集中在13个粮食主产区,本文使用数据包络分析(DEA)方法对这些粮食主产区的土地治理项目的财政支出的使用效率进行研究,对没有达到相对效率的地区进行投影分析,指出造成非有效的原因,并引入交叉有效排序方法对各地区的土地治理项目资金使用效率进行综合评价。研究表明,从总体上看,我国粮食主产区在土地治理项目上的财政支出效率是逐年提高的;农业综合开发土地治理项目的资金投入和使用方面还存在问题,资金的节约余地还很大;资金使用效率呈区域化分布。本文最后就如何提高财政农业投入产出的效率提出了相应的政策建议。