应用分子传播网络分析中国广州感染HIV-1的外国人和当地中国人的HIV传播特征

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研究背景基于HIV-1感染者病毒基因序列的差异,HIV-1分子传播网络可识别HIV-1感染者间的HIV传播关系,探究高风险人群HIV-1传播特征以及评估病毒的传播能力。移民是HIV-1感染的特殊群体,与中国HIV-1流行的关系尚未研究。男男性行为者(MSM)是HIV-1感染的高危人群之一,但部分MSM隐瞒男男性行为史,对HIV-1传播的影响尚需研究。我国HIV-1基因型构成复杂,HIV基因型对病毒传播能力的影响亟待探究。研究目的利用分子传播网络了解在华外籍HIV-1感染者、隐瞒男男性行为史的潜在MSM(pnMSM)的HIV-1传播特征,探究中国HIV-1主要流行基因型传播能力的差异,为HIV-1的精准防控提供科学依据。研究方法1.基于2008~2012年广州新确证感染HIV-1的1695名本地人与外国人的HIV-1 pol基因序列,利用HIV-TRACE和ClusterPicker两种方法构建HIV-1分子传播网络,识别可能与本地人存在HIV-1传播关系的外籍感染者。利用PastML对外籍感染者的HIV-1进行溯源。通过logistic回归分析研究与本地人有相互传播关系的外籍感染者的特征。2.基于2008~2015年广州新确证的3079名本地HIV-1感染者的HIV-1 pol基因序列,利用HIV-TRACE以两两序列基因距离0.5%作为阈值构建分子传播网络,识别pnMSM,利用网络中心性分析评价pnMSM在传播网络中的地位,利用logistic回归探究pnMSM的相关危险因素。3.以1.5%为两两序列基因距离阈值,应用上述本地感染者HIV-1 pol基因序列构建分子传播网络,计算传播簇增长指数与度中心性,以logistic回归探究HIV-1不同基因型传播能力的差异。研究结果1.广州的外籍HIV-1感染者感染了不同于中国流行的HiV-1基因型和耐药性突变的病毒株(P<0.001)。12.95%(18/139)的外籍感染者可能与感染HIV的中国人存在HIV-1相互传播。来自亚洲(OR=3.45)、报告HIV-1感染途径(OR=3.23)的男性(OR=16.88)外籍感染者更可能参与中国的HIV-1传播。2.9.92%(61/615)自称非MSM途径感染HIV的男性可能隐瞒了男男性行为史。相比于MSM,pnMSM可能年龄更大(P=0.006)、已婚(P=0.002)、受教育程度低(P<0.001)。pnMSM在HIV-1传播网络的中心性指标优于MSM(P<0.001),说明pnMSM位于传播网络中心,能更有效地传播HIV-1,对传播网络贡献更大。3.中国主要流行的HIV-1基因型的传播簇增长指数、度中心性指标均不同,说明HIV-1不同基因型的病毒株的传播能力不同。与CRF01AE相比,CRF07BC(P<0.001)和 CRF5501B(P<0.001)的传播能力更强,而 B 亚型(P<0.001)则较弱。研究结论外籍人员与本地人群HIV-1的相互传播增加了 HIV防控的复杂性,应高度重视和持续监测。隐瞒男男性行为史的潜在男男性行为者在HIV-1传播中有重要作用,且常常被忽视,需要重点关注。HIV-1基因型是影响病毒传播能力的重要因素,但是其分子机制亟待深入研究。
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