白细胞介素28B基因多态性与丙型肝炎易感性的关系及HCV基因型分布特征

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目的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)流行广泛,可导致慢性肝炎、肝硬化及肝细胞癌,已成为世界性的公共卫生难题。HCV感染主要与宿主和病毒两大因素相关。本研究旨在探索中国人群白细胞介素28B(interleukin28B, IL28B)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与丙型肝炎易感性的关系,同时研究中国各地区不同基因型HCV的流行情况,为中国HCV感染的防治工作提供相关信息。方法1.采用SNaPshot技术检测122例丙型肝炎患者和205例健康人群IL28B基因区上下游共9个SNPs位点(rs8099917、rs12980275、rs8105790、rs11881222、 rs8103142、rs28416813、rs4803219、rsl2979860、rs7248668)的基因型,比较病例组和对照组之间各SNP位点基因型和等位基因频率的差异。2.采用核酸测序法对2317例丙肝患者的HCV进行基因分型,分析其地域分布特征及与宿主性别、年龄的关系。结果1.IL28B基因区9个SNPs位点间两两强连锁不平衡(r2>0.80),以rs8099917为标签SNP进行分析。病例组和对照组rs8099917TT基因型频率分别为77.05%和86.34%,TG基因型频率分别为22.95%、13.66%,差异有统计学意义(P<0.05, OR=1.883,95%CI=1.054-3.365);两组T等位基因频率分别为88.52%、93.17%,G等位基因频率分别为11.48%、6.83%,差异有统计学意义(P<0.05,OR=1.769,95%CI=1.021-3.065)。2.2317例HCV感染者血清标本,共检测出4种基因型(1、2、3、6)和12种基因亚型。HCV1b和2a型所占比例分别为59.82%和29.35%,3b型占4.23%,3a型占2.85%,6a型占2.68%, HCV1a、2b、2b、6j、6n、6u和6v型合计占1.07%。3.HCV基因型与地域、性别、年龄(1)地域分布:HCV基因型分布表现出明显的地域差异。西南地区HCV3a、3b和6a型的检出率较高,少见亚型1a、6j、6n、6u和6v型的检出率也高于其他地区。(2)性别分布:不同性别之间HCV基因型分和不同,总体上男性和女性均以1b和2a型为主,但3a和3b型在男性中所占比例高于女性(P<0.05)。(3)年龄分布:整体上各年龄组均以1b和2a型占优势,3a、3b和6a型在21-60岁年龄组中的检出率高于<21岁和>60岁年龄组;21-60岁年龄组间,3a、3b和6a型在<40岁年龄组中的检出率高于>40岁年龄组(P<0.05)。结论1.中国人群IL28B基因多态性与丙型肝炎易感性相关,rs8099917-G、 rs12980275-G、rs8105790-C、rs11881222-G、rs8103142-C、rs28416813-G、 rs4803219-T、rs12979860-T、rs7248668-A为HCV感染的风险等位基因。2.中国地区HCV基因型分布仍以1b和2a型为主,不同地区HCV基因型频率分布存在差异,西南地区HCV基因型构成丰富,1b和2a型的检出率低于其他地区,而3a、3b和6a型的检出率明显高于其他地区。
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