围胸总目Thoracica是营固着生活的海洋甲壳动物,属于甲壳动物亚门颚足纲鞘甲亚纲Thecostraca蔓足下纲Cirripedia,是海洋生物群落中最常见、数量最多的类群之一。由于围胸类物种形态多样且缺乏分子数据,直到现在围胸类内部系统发育关系仍存在许多争议。本文采用一代测序和高通量测序技术获取了5个围胸类物种的线粒体基因组全序列。结合NCBI数据库中围胸类物种共计41个物种的线粒体基因组数据,对围胸类线粒体基因组进行了比较分析,并探讨了围胸总目的系统发育关系以及本研究五个物种的适应性进化分析。主要结果如下:1.本研究共获得了5个围胸类物种的线粒体基因组全序列,分别为马来小藤壶Chthamalus malayensis（15,230 bp）,三角藤壶Balanus trigonus（15,560 bp）,钟巨藤壶Megabalanus tintinnabulum（15,107 bp）,糊斑纹藤壶Amphibalanus cirratus（16,716 bp）和细板条茗荷Conchoderma hunteri（15,202 bp）。5个物种的线粒体基因组具有相似的基因大小、组成结构以及碱基含量。与大部分围胸类物种类似,除马来小藤壶C.malayensis缺失trn C、糊斑纹藤壶A.cirratus缺失trn F外,其他都由13个蛋白质编码基因、22个转运RNA和2个核糖体RNA组成。五个物种的lr RNA和sr RNA均于线粒体基因组轻链编码,且均被位于重链编码的trn V所分隔开。2.线粒体基因组基因排列分析显示,5种围胸类物种与泛甲壳动物原始基因排列顺序相比较均存在基因重排现象且重排方式较为复杂。但是在藤壶类中仍然存在保守的基因块,例如cox1-trn L2-cox2-trn D-atp8-atp6-cox3-trn G-nad3-trn R-trn N-trn A-trn E-trn S1。同为藤壶科的三角藤壶B.trigonus、钟巨藤壶M.tintinnabulum以及糊斑纹藤壶A.cirratus的基因排列基本一致。细板条茗荷C.hunteri相比无柄围胸类线粒体基因排列顺序,差异性很大,但是在铠茗荷亚目内部的线粒体基因排列顺序较为保守。3.系统发育分析显示,小藤壶总科位于进化树中藤壶类基部,被认为是藤壶亚目的原始分支。铠茗荷目位于整个进化树基部。藤壶科、古藤壶科和塔藤壶的物种彼此内嵌,表明这三科为非单系群。笠藤壶科与鲸藤壶科的物种彼此内嵌,说明了它们同样不是单系群;笠藤壶总科是单系群,与鲸藤壶科的龟足Capitulum mitella亲缘关系较近。该结果支持取消古藤壶科将其并入藤壶科,支持将笠藤壶总科降为笠藤壶科,并入鲸藤壶总科。4.时间分歧树与系统发育树的拓扑结构基本一致。时间分歧树表明,早期的围胸类物种出现在大概279万年前,浅海围胸类起源于深海。花笼类是无柄围胸类的原始分支。五个物种与深海物种的线粒体基因的正选择分析显示,马来小藤壶C.malayensis的nd1基因,三角藤壶B.trigonus的nd2基因,钟巨藤壶M.tintinnabulum的atp8基因,糊斑纹藤壶A.cirratus的nd5基因以及细板条茗荷C.hunteri的nd5和nd6基因均存在正选择位点。推测浅海围胸类在不同环境的演化历程中,这些基因在调节生命代谢所需能量的过程中起到了重要的作用。本研究有图24幅,表23个,参考文献122篇。