城市浅水湖泊作为城市基础设施的组成部分，在城市生态环境中起着重要的作用。为了保护湖泊生态系统，合理开发利用湖泊水资源，防止湖泊富营养化，对湖泊水流与水质进行数学模拟以掌握湖泊的水流运动规律和水质变化规律是十分必要的。湖泊水环境数学模型可以模拟湖泊水动力特征和水质变化规律，为湖泊水环境保护工作提供科学依据，是开展湖泊水环境保护工作的一个重要技术手段。本文以“金山湖”挖建工程为依托，建立了金山湖二维水流水质耦合模型，利用有限差分法离解方程，模拟了金山湖在东风作用下的流场，在此基础上模拟了水温、营养盐(总磷、总氮)、流速与浮游藻类生长的关系以及湖水水质变化趋势。通过模拟得出了金山湖作为一个城市浅水湖泊，湖流主要以风生流为主；湖泊水体交换主要靠风场来完成；验证了浮游藻类最佳生长温度为25℃；在5～8月之间水温正好在此值之间，藻类大量繁殖；验证了“水华”一般发生在夏季的结论；外源的输入带来大量的营养盐，成为金山湖水质恶化的一个主要原因，特别是面源污染成为最大危害，得出磷是藻类生长的限制性因子；得出流速越大，水体扰动越剧烈，藻类生长繁殖更快。