自主创新中知识产权风险已经成为企业发展的一大难题。大量事实证明知识产权风险已经严重阻碍了企业自主创新的积极性。虽然企业一直在改进自身管理策略来应对知识产权风险，但始终处于被动状态。因此，企业需要有效的知识产权风险管控来提升自主创新能力，以及促进自主创新绩效的取得。基于上述企业自主创新的现状和问题，本文在自主创新模式下通过对相关理论文献的总结和研究，构建了知识产权风险管控措施对知识产权风险以及自主创新绩效影响作用的模型，并基于模型提出11条关系假设。利用251个有效样本数据对假设进行验证以及分析。本研究不仅对以往研究中的一些观点提供了实证分析，也提出了一些新的观点。因此，本研究在一定程度上实现了对现有理论的深入与拓展，研究结论也对企业在自主创新活动中有效防范知识产权风险具有一定的现实指导意义。本文主要创新性工作及其结论总结为三个部分：（1）将知识产权风险管控措施、知识产权风险与自主创新绩效归入一个分析框架中研究，多维度下探讨三者之间的作用关系。在大量关于知识产权风险管控方面的定性研究基础上，对知识产权风险管控进行量化分析，利用样本数据分析发现知识产权风险管控措施可以有效降低知识产权风险、提高自主创新绩效。研究结论不仅补充和丰富了知识理论与风险理论相关研究内容，也对企业提高企业自身知识产权风险管控能力具有一定的实践意义。（2）提出并且验证了风险管控措施对知识产权风险的反向作用关系，以及对自主创新绩效的正向作用关系。以往对知识产权风险管理控制是从法律角度进行研究，本文则从管理控制理论出发，研究其对风险与创新绩效的影响关系。同时本文验证了知识产权产生过程中的吸收风险、研发风险和应用风险对自主创新绩效的反向影响，深入细化了二者的关系作用。（3）在研究知识产权风险管控措施与知识产权风险关系的结果中，发现了正式管控措施对知识产权风险的影响更为显著，可依据不同类别的知识产权风险采用更为细致的管控措施进行防范。该研究结论在一定程度上弥补了以往风险管理理论相关研究的不足，对我国企业开展自主创新活动也具有现实意义。