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人白细胞抗原（humanleukocyteantigen，HLA）等位基因的高度多态性决定了它们不同的多肽结合基序和随后的T细胞受体（TCR）识别。为了更好地理解不同等位基因对多肽的交叉呈递，常将HLA等位基因分类为不同的超级型。A1和A3超级型在人群中广泛分布。然而，针对这些等位基因（例如HLA-A*3001和HLA-A*3003）的多肽呈递特征缺乏直接的结构和功能证据。
在本研究中，我们通过体外复性，晶体结构解析和蛋白热稳定性试验明确了HLA-A*3001和HLA-A*3003呈递分别来自流感病毒、人类免疫缺陷性病毒和结核分枝杆菌T细胞表位（NP44，RT313和MTB）的分子基础。
当与人类免疫缺陷性病毒的多肽RT313结合时，HLA-A*3001和HLA-A*3003F口袋与多肽RT313PΩ-Lys的锚定模式和A3超级型中的HLA-A*1101类似。然而，HLA-A*3003也能与A1超级型特异性多肽NP44结合，且HLA-A*3003/NP44的结合模式和A1超级型等位基因HLA-A*1101/NP44结合模式不同。此外，HLA-A*3003同时也能与A1超级型特异性多肽MTB结合，而HLA-A*3001不能和MTB体外复性。因此，与我们先前的理解不同，HLA-A*3001和HLA-A*3003具有不同的多肽结合基序，导致其不同的超级型分类，即HLA-A*3001属于A3超级型，而HLA-A*3003属于A1A3超级型。同时，我们发现组成F口袋的77位氨基酸残基是造成HLA-A*3001和HLA-A*3003不同多肽呈递特征的关键。在HLA-A*3001和HLA-A*3003之间交换77位氨基酸残基后，它们的多肽结合基序发生了互换。
我们的研究结果为疫苗开发和免疫治疗中筛选病毒和肿瘤特异性多肽提供了重要依据。
在本研究中，我们通过体外复性，晶体结构解析和蛋白热稳定性试验明确了HLA-A*3001和HLA-A*3003呈递分别来自流感病毒、人类免疫缺陷性病毒和结核分枝杆菌T细胞表位（NP44，RT313和MTB）的分子基础。
当与人类免疫缺陷性病毒的多肽RT313结合时，HLA-A*3001和HLA-A*3003F口袋与多肽RT313PΩ-Lys的锚定模式和A3超级型中的HLA-A*1101类似。然而，HLA-A*3003也能与A1超级型特异性多肽NP44结合，且HLA-A*3003/NP44的结合模式和A1超级型等位基因HLA-A*1101/NP44结合模式不同。此外，HLA-A*3003同时也能与A1超级型特异性多肽MTB结合，而HLA-A*3001不能和MTB体外复性。因此，与我们先前的理解不同，HLA-A*3001和HLA-A*3003具有不同的多肽结合基序，导致其不同的超级型分类，即HLA-A*3001属于A3超级型，而HLA-A*3003属于A1A3超级型。同时，我们发现组成F口袋的77位氨基酸残基是造成HLA-A*3001和HLA-A*3003不同多肽呈递特征的关键。在HLA-A*3001和HLA-A*3003之间交换77位氨基酸残基后，它们的多肽结合基序发生了互换。
我们的研究结果为疫苗开发和免疫治疗中筛选病毒和肿瘤特异性多肽提供了重要依据。