甲基化调控hsa-let-7g在神经管畸形中的作用及印记基因在重大发育性疾病中变化的探讨

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研究背景怀孕期间叶酸缺乏会增加神经管畸形(neural tube defects,NTDs)发生的危险性。已有研究表明mi RNA调控紊乱与叶酸缺乏NTDs相关。然而,NTDs发病机理中叶酸调控mi RNA的相关机制尚未明确。课题组前期研究发现,在NTDs脑组织中多种mi RNAs的甲基化水平发生变化,其中hsa-let-7g甲基化的变化显著,此结果提示,在NTDs中可能存在DNA甲基化与mi RNA表达水平的相互作用。研究目的探讨叶酸缺乏介导的hsa-let-7g在NTDs发生中的调控机制。研究方法本研究采用病例对照研究方法,比较NTDs和对照组脑组织中叶酸浓度和hsa-let-7g甲基化水平的差异,分析二者相关性;采用不同浓度5-Aza处理HCT-15细胞,研究hsa-let-7g甲基化水平对hsa-let-7g表达的影响;利用hsa-let-7g转染后的SK-N-SH细胞研究hsa-let-7g的表达对细胞迁移和增殖的影响,并通过hsa-let-7g潜在靶基因的表达水平检测分析hsa-let-7g在NTDs发病机制中的作用。研究结果1、与对照组相比,NTDs脑组织中hsa-let-7g启动子区甲基化水平显著降低。2、在NTDs中hsa-let-7g甲基化水平与脑组织叶酸水平显著正相关。3、在HCT-15细胞中证实hsa-let-7g的甲基化直接调控hsa-let-7g的表达。4、hsa-let-7g可能通过调节靶基因SMOX的表达水平,抑制细胞的迁移和增殖。研究结论叶酸缺乏改变hsa-let-7g甲基化修饰,调控hsa-let-7g过表达,进而抑制细胞迁移和增殖,可能是低叶酸诱导NTDs发生的调控机制之一。研究背景神经管畸形(neural tube defects,NTDs)、胚胎停止发育和先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)作为重大发育性疾病发病率较高,遗传和环境的交互作用被认为是主要的致病因素。近来从表观遗传调控的角度研究重大发育性疾病的发生机制成为一个新的研究方向,其中DNA甲基化是生物体基因组的主要表观遗传修饰方式,也是调节基因组功能的重要手段。印记基因通过标记双亲来源信息的生物学过程实现对胚胎生长发育的调控。印记基因中的甲基化差异区域(DMR)在基因印记建立中起重要作用,DMR缺失或DMR内Cp G位点甲基化修饰异常会引起整个印记基因簇表达的紊乱,印记基因的表达异常会影响正常基因组印记,破坏亲代双方遗传物质的平衡而影响胚胎的正常发育。研究目的分析印记基因的印记异常与重大发育性疾病发生的关联,为进一步探讨印记基因表观修饰异常在重大发育性疾病中的可能机制奠定基础。研究方法本研究参考印记基因分析资源,选择现已证实的18个基因的DMR区域:GRB10、INPP5F、PEG10、MCST、NNAT、NAP1L5、NESPAS、GNAS、PLAGL1、MEST、KVDMR、SNRPN、ZIM2、NESP、H19、IGF2、IG、MEG3,作为研究的序列,采用病例对照研究方法,收集神经管畸形、胚胎停育、先天性心脏病及对照组样本,提取DNA并进行重亚硫酸盐修饰,对修饰后印记基因DMR进行PCR扩增,并进行PCR产物的酶切处理,用Mass ARRAY?Epi TYPER?高通量甲基化分析方法对DMR甲基化水平进行检测。研究结果1、神经管畸形(NTDs)、胚胎停止发育和先天性心脏病(CHD)重大发育性疾病中均存在部分印记修饰的改变。2、印记基因PEG10及IG DMR在NTDs样本中甲基化水平比对照组样本中甲基化水平显著性升高。3、印记基因INPP5F、NESPAS和MEST DMR在胚胎停止发育样本中甲基化水平比对照组样本中甲基化水平显著性升高。异常增高的NESPAS DMR会增加先天性心脏病的患病风险。4、印记基因GRB10和MEST DMR在CHDs中甲基化水平比对照组样本中甲基化水平显著性升高,INPP5F、PEG10、NAP1L5、PLAGL1、NESP和MEG3 DMR在CHDs中甲基化水平比对照组样本中甲基化水平显著性降低。异常增高的GRB10 DMR甲基化水平和降低的INPP5F、PEG10、PLAGL1、NESP、MEG3 DMR甲基化水平会增加先天性心脏病的患病风险。研究结论1、神经管畸形中发现印记基因PEG10、IG DMR甲基化修饰水平改变。2、胚胎停止发育中发现印记基因INPP5F、NESPAS和MEST DMR甲基化修饰水平改变。3、先天性心脏病中发现印记基因GRB10、MEST、INPP5F、PEG10、NAP1L5、PLAGL1、NESP和MEG3 DMR甲基化修饰水平改变。
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