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位于细菌脂肪酸合成途径延伸循环的第二个酶是β-酮脂酰-ACP还原酶(FabG),FabG在还原型辅酶ⅡNADPH的协助下,催化β-酮酯酰-ACP C3位的羰基还原为羟基。FabG属于短链脱氢酶/还原酶超家族(SDR)的成员。绿茶提取物的主要成分是表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG),同时EGCG也是细菌Ⅱ型脂肪酸合酶系统中β-酮酰基-ACP-还原酶(FabG)的有效抑制剂,这是一种广泛的植物多酚所共有的特性,本文针对EGCG与相关植物多酚抑制β-酮酰基-ACP-还原酶(FabG)的作用机制进行研究。首先运用分子对接、分子动力学模拟、DSSP以及结合自由能分解(MM-PSBA)等计算方法,计算EGCG和相关植物多酚配体与FabG受体形成的复合物体系之间各类相互作用的参数如RMSD、Rg、RMSF、氢键、二级结构以及相对结合自由能等,研究了这些参数随分子动力学模拟进行而发生的变化及变化规律。实验结果表明,当无配体存在时,FabG单体体系稳定性较差,回旋半径较小,蛋白质折叠较为紧凑,活性通道附近柔性较大的区域氨基酸残基波动较大,二级结构不稳定;当EGCG与相关植物多酚存在时,其侧链羟基可与活性位点关键残基Ser138、Tyr151之间或与Loop区关键残基Asp92、Gln148、Ile184之间形成氢键,占据活性位点。同时,配体也可与辅酶NADPH形成氢键及π-π堆叠作用,进一步固定侧链。其次,将本课题组前期合成的有抗菌生物活性的含邻羟苯基的三唑类化合物构建成小分子化合物库,并与FabG以及其他三个抗菌活性靶标(FabI、FabH、FabB)进行分子对接筛选。探究这类化合物与各个靶标的结合模式,研究配体与受体之间的作用规律。研究结果表明,将含邻羟苯基的三唑类化合物以化学结构分成四类,其中这四类化合物对FabG和FabB均表现出良好的亲和性;第Ⅰ、Ⅲ类化合物与FabI的辅酶NAD~+的烟酰胺环形成氢键或π-π堆叠作用,表现出较强的结合能力。