本文运用基因组控制的方法对患病兄弟对(affected sib-pair,ASP)中存在半兄弟对(mixed affected sib-pair,MASP)导致的偏差进行校正。如果有一个未知比例的半兄弟对(half-sib)混入完全兄弟对(full-sip)样本中，基于传统的完全兄弟对的一系列非参数方法ASP连锁检验将产生剧烈的偏差。基因组控制的方法是通过除了候选的疾病基因位点外，找到许多零基因位点(null loci)，它们与疾病无关，但是却可以估算出半兄弟对在整个样本中的比例，这样我们便可以对半兄弟对导致的统计量均值偏差和方差偏差进行校正，进而得到合理的检验统计量。基因组控制的方法已经很成熟的运用在关联分析当中，它可以显著的消除人口层次差异带来的影响。本文通过模拟发现，基因组控制的方法同样可以运用在混合患病兄弟对的连锁分析当中，而且不同于以往的关联分析，连锁分析当中的零基因位点的等位基因概率与候选疾病基因位点的等位基因概率没有强制性要求，这就让我们选取零基因位点拥有的相当大的灵活性。最终模拟结果显示，不论样本大小和半兄弟对比例，如果我们选取30或以上个零基因位点，本方法可以显著校正均值和方差的偏差。此外，我们还可以发现，即使零基因位点和疾病有很小的关联性，本方法做的校正依然很有效。