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目的：探讨Wnt11基因rs12419707和rs1533767多态性与甘肃省儿童非综合征性唇腭裂发病之间的关系。方法：选取110例非综合征性唇腭裂患者为实验组；108例正常儿童为对照组。采用飞行质谱技术对Wnt11的两个多态性位点进行检测,记录并分析基因型,用病例对照的方法进行统计分析,计算110例患儿与108例正常儿童的基因型及基因频数。结果：对Wnt11基因rs12419707,110例NSCL/P患者和108例正常儿童基因型及等位基因频数病例对照研究显示,结果无统计学差异(x2=2.380,P>0.05)；NSCL/P患儿不同类型与正常儿童的基因型和等位基因频数相比较,仅单纯性唇裂与对照组结果有统计学差异(x2=9.850,P<0.05)；有家族史与无家族史患儿基因型和等位基因频数的比较,结果无统计学异(差x2=0.028,P>0.05)。对Wnt11基因rs1533767,110例NSCL/P患儿和108例正常儿童基因型及等位基因频数病例对照研究,结果无统计学差异(χ2=1.647,P>0.05)；NSCL/P患儿不同类型与正常儿童的基因型和等位基因频数相比较,结果无差异性；有家族史与无家族史患儿基因型和等位基因频数的比较,结果无统计学差异(x2=0.623,P>0.05)。两个位点对NSCL/P的发病的联合作用结果显示无明显的联合作用。结论：Wntl 1基因rs12419707和rs1533767多态性可能不是甘肃儿童发生NSCL/P的遗传易感因素。