以腐木枯枝为基质完成其全部或部分生活史的半知菌类真菌占腐生真菌的多数，是一个重要的大类群。本研究通过对南部地区腐生半知菌物种的调查，深入了解该类基质半知菌的存在状况，发现更多的新属种真菌资源，为今后相关真菌分类及利用研究奠定基础。本研究从云南、广州、湖南等地采集大量枯枝标本，经室内处理分类研究，从300余份腐木枯枝标本中，共鉴定出真菌15个属，一个疑难属（包括3个待定种），34种，其中新种5个，中国新记录种7个。发现的属有蜗孢属Helicoma，Dicranidion属，接柄孢属Zygosporium，Gyrothrix属，Pseudodictyosporium属，Kionochaeta属，角状孢属Ceratosporium，顶孢属Exserticlava，指状孢属Digitoramispora，Piricauda属，类色串孢属Taeniolina，束柄霉属Podosporium,爱氏霉属Ellisembia,葚孢属Sporidesmium,长蠕孢属Helminthosporium。发现的新种有：Kionochaeta pseudoramifera，焦作类色串孢Taeniolina jiaozuoensis，柱喙长蠕孢Helminthosporium cylindrorostrum，拟多隔长蠕孢Helminthosporiumpseudomultiseptatum，南京长蠕孢Helminthosporium nanjingense；中国新记录种有：Helicoma.palmigenum， Gyrothrix circinata， Piricauda cochinensis， Helminthosporiummauritianum, Helminthosporium claviphorum,黄檀长蠕孢Helminthosporium dalbergiae,Helminthosporium kakamegense。本研究中关于长蠕孢属的调查，对包括实验室保存，同行赠送及笔者采集在内共计70个菌株资源进行观察并纯化，依据长蠕孢属的形态特征共鉴定出16个种，（3个种未分离出菌株），3个新种，3个中国新记录种，4个未知种。对已获得菌株分别对5.8S rDNA-ITS区、Gpd基因和ACT基因进行了扩增和序列测定，结果发现只有5.8S rDNA-ITS区基因扩增率100%，供试的43个菌株均扩增出目的片段，供试菌株的Gpd基因片段成功扩增出目的序列38个，供试菌株的ACT基因片段成功扩增出目的序列36个。这3个基因对本研究长蠕孢属内多数的种都能进行较好的区分，可以作为长蠕孢属内的分子鉴定和遗传分析的依据。通过这3个基因对长蠕孢属部分种及其近似属的系统学遗传分析，结果表明新种南京长蠕孢H.nanjingense及中国新记录种H.kakamegense与模式种H.velutinum的亲缘关系最远，羊蹄甲长蠕孢H.bauhiniae与模式种绒长蠕孢H.velutinum的亲缘关系更近，其中有3个种分别为广西长蠕孢H.guangxiense，东兴长蠕孢H.dongxingense，茄长蠕孢H.solani共5个菌株的分类地位未得到的明显的确认，仍待进一步的研究；本研究的4个未知种，通过分子鉴定确定了一个未知种H.sp.1ZM020441为H.kakamegense，另外3个未知种的分类地位需进一步研究；通过依据形态特征鉴定，结果发现模式种绒长蠕孢H.velutinum的多数菌株种内差异较大，经过仔细的比对鉴定，将绒长蠕孢的菌株分为平均分生孢子宽度在14-16μm的a类群和平均分生孢子宽度在16-18μm的b类群以及分生孢子宽度兼有的中间类型；通过对以上3个基因片段及3个基因片段聚合系统发育分析，发现绒长蠕孢H.velutinum种内发生分化，除了中间类群外种下基本分为2大单元群，且不同单元群里的菌株多数吻合形态鉴定的类群。