小麦根长相关基因的挖掘

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:X2000N
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小麦是目前世界上种植最为广泛的三大主要谷物之一,40%的世界人口以小麦为主要粮食作物。现阶段,干旱是全球范围内制约作物生长和影响作物产量最严重的非生物胁迫之一。小麦根系活力、土层分布和生长势是影响作物生长发育的主要因素。以根长为出发点发掘抗旱遗传位点,分析其遗传基础和网络,不仅可以为小麦抗旱理论积累研究数据和经验,还可以为重要根长QTL进行小麦抗旱育种提供理论参考和基因资源。我们对选取的768份小麦自然群体进行根长性状表型分析,768份小麦群体中国内品种占684份,国外引进品种84份。684份国内品种中263份取自黄淮海麦区,根长性状平均值为15.99cm,变异系数为18.26%,其中改良品种242份,根长性状平均值为16.28cm,变异系数为17.07%,地方品种21份,根长性状平均值为12.63cm,变异系数为18.53%。684份国内品种中120份取自长江中下游麦区,根长性状平均值为15.86cm,变异系数为16.77%,其中改良品种77份,根长性状平均值为16.37cm,变异系数为15.82%,地方品种42份,根长性状平均值为15.05cm,变异系数为15.68%。684份国内品种中88份取自北部麦区,根长性状平均值为14.65cm,变异系数为22.89%,其中改良品种72份,根长性状平均值为14.89cm,变异系数为24.17%,地方品种16份,根长性状平均值为14.11cm,变异系数为15.71%。684份国内品种中76份取自西北麦区,根长性状平均值为14.57cm,变异系数为19.97%,其中改良品种48份,根长性状平均值为14.86cm,变异系数为19.98%,地方品种28份,根长性状平均值为13.82cm,变异系数为18.88%。684份国内品种中77份取自西南麦区,根长性状平均值为14.61cm,变异系数为16.15%,其中改良品种45份,根长性状平均值为15.02cm,变异系数为15.78%,地方品种32份,根长性状平均值为13.98cm,变异系数为15.67%。通过对群体进行关联分析发现5个与根长性状相关的显著的信号,分别位于4B,7B,6D,7D染色体上。其中位于4B染色体上峰值SNP为AX-110397284,位于1220735bp,P值为6.30×10-5;位于7B染色体上两个峰值SNP为AX-94418646和AX-110445547,其中AX-94418646位于426881189 bp,P值为1.16×10-6。AX-110445547位于612607992bp,P值为8.80×10-6;位于6D染色体上峰值SNP为AX-109235132,位于665400815bp,P值为2.47×10-11;位于7D染色体上峰值SNP为AX-111729400,位于420359481bp,P值为1.32×10-4。我们对位于6D染色体信号最强的信号进行LD定位并挖掘到13个根长相关候选基因,其中TraesCS6D02G384500为根系特异表达基因,在根长两次重复TMP(Transcripts Per Million)分别为99.04和108,而在叶片中两次重复TMP分别为1.16和9.73。该候选基因与拟南芥FBR12为同源基因,与调控根系发育相关。
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