支付系统是支持社会经济发展、金融运行的重要基础设施,是现代金融服务体系的主要功能之一。支付清算体系是国民经济和社会资金流动的大动脉,在方便市场交易,减少现金使用,维护市场秩序,规范结算行为,防止支付风险,加快资金周转,畅通货币政策传导,密切各金融市场有机联系,推动金融工具创新,提高资源配置效率,打击洗钱、逃债、逃贷和腐败等方面发挥着极其重要的作用。构建安全、高效的支付清算体系有利于各项支付结算工具的高效运转,有利于通过控制系统性风险,维护金融体系的安全稳定性。经过多年的努力,我国的支付清算体系建设已经初具规模,形成了一个以中国支付系统(包括大、小额支付系统)为核心,商业银行行内资金汇划系统为基础,各地同城票据交换系统并存的中国支付系统架构,建立了以“三票一卡三方式”为主体的支付结算制度,发展了信用支付工具。随着现代科技的不断发展,推动了网上支付,第三方支付等支付工具的电子化；推动了支付系统的持续改进。目前的支付系统几乎覆盖了所有支付工具的应用,为社会资金的快速运行提供了重要渠道。随着近年来我国社会经济的快速发展,经济规模不断扩大,商业银行的业务运营和管理体系都发生了深刻的变化,对中央银行的支付清算服务提出了许多新的、更高的要求。为适应新的发展需要,中国人民银行正式启动了第二代支付系统的建设,该系统的建成将为商业银行提供更加灵活的接入方式、更全面的流动性风险管理、更便捷的网上银行互联平台、更国际化的业务技术标准和更强大的数据挖掘功能。第二代支付系统的建设将对满足社会经济的支付需求、促进经济金融又快又好发展将产生积极意义。作为金融核心的商业银行在金融体系中发挥着至关重要的作用,支付结算业务是商业银行的一项传统业务,其能否合规、合法、顺畅的进行操作直接影响到商业银行的信誉和生存,进而影响金融稳定。本文从我国支付系统的总系架构出发,分析了支付系统的国内外发展现状,为了更好地在商业银行资金清算中应用支付系统,本文以某商业银行为例,具体分析了某商业银行支付系统的现状,着重从支付系统发展中存在的问题着手,分析二代支付给某商业银行带来的优势、劣势、机遇和挑战,以及商业银行采取的应对策略,对二代支付系统的发展提出了自己浅显的建议,以使我国支付系统的发展更多地考虑相关业务系统的关联性,提高系统效率,商业银行要正确认识二代支付系统上线后带来的支付清算体制上的变革,积极应对、合理规划、统筹安排,适应新形势下的现代化支付系统建设步伐。