蛋白质吸附广泛应用于生物医学、生物材料、蛋白质分离、药物输送等领域。由于蛋白质吸附的复杂性,人们对其机理仍然缺乏完整、准确的了解。分子动力学模拟可以从分子水平上研究蛋白质吸附过程,获得实验无法得到的信息。聚乙烯是一种结构简单、应用广泛的高分子材料,普遍应用于人工关节等生物医学材料。本文利用GROMACS软件对聚十赖氨酸多肽、牛胰蛋白酶抑制剂和人体溶菌酶在聚乙烯界面上的吸附进行了分子动力学模拟,研究了不同表面形态、不同侧链电荷、不同水分子模型、不同力场条件、不同多肽-表面间距离等因素对吸附过程的影响。在长方体盒子周期性边界条件下,利用最速下降法进行初始结构的能量优化,采用NVT系综,使用蛙跳法进行了分子动力学模拟。非键相互作用的计算采用截断值法PME方法。根据蛋白质二面角变化和拉氏构象图分布分析了吸附过程中蛋白质分子的构象变化;并对吸附过程中蛋白质的回转半径、溶剂可及面积以及蛋白质和聚乙烯界面间的作用能进行了分析。模拟结果表明,聚乙烯表面对带侧链电荷的聚十赖氨酸的吸附作用强于对不带侧链电荷的吸附作用;无规聚乙烯表面对聚十赖氨酸的吸附作用强于规整聚乙烯表面对聚十赖氨酸的吸附作用;水分子通过氢键对聚十赖氨酸的吸附有很大的影响。动力学模拟还表明,水分子模型和力场的选择均对模拟结果有影响。采用SPC水分子模型,聚乙烯表面对聚十赖氨酸的吸附作用最强;在AMBER94力场下,聚乙烯表面对聚十赖氨酸的吸附强于GROMACS力场下的吸附。构象分析表明,在吸附过程中蛋白质分子的构象发生了变化。聚十赖氨酸分子中的α-螺旋结构几乎全部丢失;牛胰蛋白酶抑制剂中的β-折叠结构部分丢失;人体溶菌酶中的α-螺旋结构也发生了部分丢失。能量分析表明,聚乙烯界面与蛋白质分子之间的范德华作用是蛋白质吸附的主要推动力。