医药分销物流系统作为医药价值链中的重要组成部分，连接着医药生产企业与各级零售终端，实现医药品和医学信息的传递，对医药价值链整体效益的实现发挥着关键作用。因此，研究如何基于价值链原理分析医药分销物流系统的价值特性，区分价值链中的增值环节、保值环节和减值环节，从而优化医药分销物流系统，实现各个子系统的有机结合，发挥医药分销物流系统的整体效应，对于降低医药流通环节的物流成本、加速药品流通速度，提高运营效益、规范建设药品流通市场，从而缓解药价虚高现象具有重要的经济与社会现实意义。本文通过分析医药行业现存的相关社会热点问题，明确了拟要解决的其一关键问题是对医药分销物流系统构成相关元素的价值分析并以此为依据确定更具价值效益的分销物流系统的结构模式及运作范式，以及在构建医药分销物流系统中各节点选址的合理性和运输路径的优化分析，以满足医药企业在“电子商务”环境下构建新型物流分销系统的需求。以此为研究目标，查阅了大量国内外文献资料并分析了已有的研究成果，依据价值链分析原理和物流系统规划和设计方法，对医药企业现行的分销物流系统构成要素进行了价值分析和分销物流系统的合理运作的结构设计，本研究指出由一级大型医药物流中心和二级医药配送中心构成的两级医药分销物流系统是一种更具价值效益的分销模式，通过应用现代物流技术和管理系统，规范性建设药品流通市场，控制子系统的运作成本，能够合理的控制终端药品的价格，提高客户的药品获得安全性，并对影响物流需求响应效应和成本的影响因素——物流配送中心选址和配送中心路径优化这两个问题，选用鲍摩-瓦尔夫模型和遗传算法模型对算法的有效性和适用性进行了应用性分析和可行性验证，为国内医药企业解决医药分销物流系统的优化问题提供了可供借鉴的算法模型。