经济发展实践表明,经济发展关键的因素并不是自然资源,物质条件,而是人力资本及其均衡的结构,人力资本是劳动力技能的价值表现,提高劳动力素质会提高一个地区的产出水平,成为经济增长的决定因素之一。由劳动者素质差异形成的人力资本结构,与区域经济发展之间存在相互促进的关系,合理的人力资本结构对区域经济均衡协调发展有重要意义,反之,则阻碍着经济发展的进程。从区域经济差异层面研究人力资本结构对缩小经济差距的影响,是一个较为现实的问题。西部大开发十年来,伴随着新疆经济的快速发展,区域间经济差异问题日益突出,不利于新疆经济社会的平稳发展,缩小区域经济差异是一个较为现实的问题。以人力资本理论为基础,从人力资本结构与区域经济差异的关系入手,在对人力资本理论及区域经济差异分析的基础上,用新疆15个地州市的面板数据建立人力资本评价的指标体系,进行因子分析,对各地州市人力资本极其结构协调性作出评价。并重点分析了人力资本结构状况对区域经济差异的影响,并根据实际提出了平衡新疆区域经济发展,优化人力资本结构的对策。