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目的通过对NKX2-5基因和GATA4基因外显子序列及非编码区单核苷酸多态性(SNP)进行分析和关联研究,探究其与高原藏族先天性心脏病(CHD)的关系。方法收集2016年至2019年在青海大学附属医院被诊断为CHD的藏族患者(实验组)和健康藏族血液样本(对照组),其中第一部分实验共有实验组样本70例,对照组样本70例;第二部分实验共有实验组样本103例,对照组样本267例。对NKX2-5基因2个外显子和GATA4基因7个外显子分段设计引物并测序;采用Sequenom Mass ARRAY?SNP技术对NKX2-5基因和GATA4基因候选SNP进行分型检测。实验数据采用SPSS19.0统计软件处理。实验组及对照组间年龄比较采用χ2检验,性别比较采用t检验。样本群体的代表性用哈迪-温伯格平衡检验。各组间基因型、等位基因频率、连锁不平衡和单体型分析采用网页http://analysis.bio-x.cn计算,用相对危险度(OR)、95%置信区间(CI)和p值表示分析结果。结果1、外显子测序结果发现:在实验组和对照组发现NKX2-5基因外显子1第63位密码子碱基(rs2277923)和外显子2第606位密码子碱基(rs3729753)发生了同义替换,GATA4基因外显子6第1129位密码子碱基(rs3729856)发生了非同义替换,未发现其他外显子序列的改变。NKX2-5基因rs2277923基因型和等位基因频率无差异,rs3729753不符合哈迪-温伯格平衡定律,统计分析时予以剔除;GATA4基因rs3729856基因型和等位基因频率无差异。2、NKX2-5基因非编码区发现rs6882776和rs2546741共2个SNP位点在实验组和对照组之间差异有统计学意义,GATA4基因非编码区发现rs117982404和rs12458共2个SNP位点在实验组和对照组之间差异有统计学意义。3、NKX2-5基因的8个SNP位点和GATA4基因的20个SNP位点进行连锁不平衡分析,发现各基因位点之间存在强连锁不平衡。NKX2-5基因的单体型CAACTCAG(OR=1.674,95%CI=1.062-2.638,p=0.025)、CGGCTCAG(OR=51.860,95%CI=11.972-224.658,p<0.001)和GATA4基因的CCACGAGCCCG GCTACTCAC(OR=1.887,95%CI=1.023-3.481,p=0.040)、CTGCGAGTCCGG CTACTTTC(OR=19.238,95%CI=4.848-76.339,p<0.001)是CHD的危险性因素,但NKX2-5基因的单体型CAGCTCAG(OR=0.158,95%CI=0.070-0.356,p<0.001)、CAGCTCGG(OR=0.043,95%CI=0.006-0.306,p<0.001)和GATA4基因的单体型CCACGAGCCCGGCCACCCAC(OR=0.475,95%CI=0.227-0.992,p=0.043)、CTGCGAGTCCGGCTACTCTC(OR=0.110,95%CI=0.017-0.725,p=0.006)、CTGCGAGTCCGGCTACTTAC(OR=0.162,95%CI=0.050-0.519,p=0.001)是CHD的保护性因素。结论1、NKX2-5基因外显子的rs2277923位点和GATA4基因外显子的rs3729856位点与高原藏族CHD的易感性无关。2、NKX2-5基因非编码区的rs6882776、rs2546741位点以及GATA4基因非编码区的rs117982404、rs12458位点在实验组和对照组间基因型和等位基因频率对比有显著性差异,但是否与CHD的发生有关联性,有待今后做进一步地研究。3、NKX2-5基因和GATA4基因选取的SNP位点之间存在强连锁不平衡,NKX2-5基因和GATA4基因的单体型与CHD相关。