企业孵化器的产生和发展不是偶然的经济现象,而是具有深刻的理论基础,尤其是创业孵化集团的组织创新更显现出孵化器理论研究的不足。本文从创新市场失灵视角,通过对新创企业特征的分析,得出企业新创过程中存在市场价格机制失灵和企业契约机制失灵的双重约束,并进一步分析了这两种市场失灵的特点。孵化器作为价格机制失灵和契约机制失灵的替代,是一种基于市场属性的组织创新,通过把创业者和管理者、创意和资本融为一体,凝聚创新资源,实现自身利益最大化。在此理论分析基础上,本文进一步进行了孵化器的租赁、管理和投资等功能的分析,构建了孵化器管理功能的创新资源整合模型和投资功能的投资收益模型,认为孵化器对内追求创新资源的配置效率,对外追求创新资源的协调效率。而且为了使理论更直观,对idealab!进行了案例分析,更进一步延伸理论研究的结论。