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塔里木河流域是自然生态系统脆弱区,气候干旱、光热充足,但水资源匮乏。该流域还是新疆的典型农牧区,农用地资源是流域内的基础性资源;由于受生态环境条件制约,加之资源禀赋、人口等因素影响,长期陷入农用地资源利用不合理、经济发展缓慢与生态环境恶化的多重困境。因此,开展农用地生态经济系统研究就成为一项具有理论与实践意义的重要工作。本文在生态经济学、土地生态学等基础理论的指导下,通过对土地生态经济学理论的深化,阐述了农用地生态经济系统的概念与内涵,并以塔里木河流域为例进行了深入分析。在此基础上,借鉴系统耦合的有关研究,运用系统耦合模型对塔里木河流域农用地生态经济系统耦合态势进行了评价与分析,并对该流域农用地生态经济系统耦合发展的基本思路与模式进行了探讨,最后提出了科学调控流域农用地生态经济系统耦合发展的对策建议。研究结果表明:①塔里木河流域农用地生态经济系统是一个开放的、高级复合系统,水资源在系统中具有关键作用,且系统所处环境具有一定特殊性。②1997-2006年间,流域农用地生态子系统与社会经济子系统综合指数均呈增长趋势,反映了流域农用地生态经济系统整体发展良好。③通过计算系统耦合度发现,塔里木河流域农用地生态经济系统在1997-2001年、2002-2004年、2005-2006年三个时间段分别处于过度开发型、强烈开发型与协调发展型,经历了由不协调到协调的发展过程。④明确了流域农用地生态经济系统耦合发展的基本思路:以生态经济学理论为基础,处理好发展与保护的关系,构建生态与经济良性互动的发展模式;发展生态农业是实现农用地生态经济利用的有效途径;淡化开荒理念,强化生态意识,维持农用地适度规模。在此基础上尝试构建了区域开发模式、层次开发模式、平面复合型农业生态经济模式、庭院设施生态经济模式、城郊生态农业模式、生态保护和扶贫开发模式等农用地生态经济模式。⑤农用地生态经济系统优化调控遵循结构—功能原理与系统性原理两个基本原理,在体制观念、水资源开发利用、产业结构调整、人口、土地、资金、法律法规等方面提出了系统优化调控的对策建议。