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目的：本研究通过检测Cox-2、5-Lox及Bcl-2蛋白在胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors，GISTs)中的表达水平，分析其与临床病理特征的相关性，探讨Cox-2、5-Lox、Bcl-2在胃肠道间质瘤中的表达情况及其临床意义。方法：收集泸州医学院附属医院病理科2007年1月～2011年12月存档蜡块120例，包括GISTs组100例，其中低度危险组28例、中度危险组40例、高度危险组32例，正常胃肠道组织20例作为对照组。每例标本组织学类型均经病理诊断证实，复阅组织切片，并用免疫组织化学SP法检测Cox-2、5-Lox及Bcl-2在GISTs及正常胃肠组织中的表达水平，分析Cox-2、5-Lox和Bcl-2的表达的相互关系及与GISTs临床病理特征的相关性。采用SPSS17.0统计软件分析，计数资料采用卡方检验及Fisher精确概率法检验，相关性分析采用pearson列联相关分析。结果：（1）Cox-2、5-Lox、Bcl-2在GISTs中阳性表达率分别为68%、77%、85%，均高于在正常胃肠组织中的表达15%、20%、15%，差异有统计学意义（p<0.05）。（2）Cox-2、5-Lox、Bcl-2的表达在低、中、高危组中呈逐渐增高趋势，差异有统计学意义(X~2=8.396，7.498，6.162，p<0.05)。进一步两两比较，Cox-2在低危组和中危组、高危组之间的表达有统计学意义（X~2=5.783,6.461, p<0.05）；5-Lox在低危组、中危组和高危组之间的表达有统计学差异（X~2=6.104,6.402,p<0.05）；Bcl-2只在低危组和高危组之间差异有显著性（X~2=6.687,p<0.05）。（3）Cox-2、5-lox在GISTs中的表达与患者的年龄、性别、肿瘤部位、大小、核分裂数等临床特征无明显关系(p>0.05)； Bcl-2的表达与核分裂数有关(X~2=4.286，p<0.05)，与患者的年龄、性别、肿瘤部位、大小等临床特征无明显关系(p>0.05)。（4）Cox-2、5-Lox、Bcl-2在GISTs中阳性表达率的相关分析表明：Cox-2、5-Lox与Bcl-2的表达呈正相关(r=0.227,0.275, p<0.05)；Cox-2与5-Lox在GISTs组织中的表达无明显相关性(r=0.157, p>0.05)。结论：（1）Cox-2、5-Lox、Bcl-2在GISTs中阳性表达率高，推测三者可能参与GISTs的发生发展进程。（2）联合检测Cox-2、5-Lox、Bcl-2的表达，可能作为GISTs早期诊断、判断侵袭性及预后的一项客观指标，特异性地对三者进行抑制可能有效抑制肿瘤的发展，改善预后。（3）Cox-2、5-Lox分别与Bcl-2的表达呈正相关,提示Cox-2、5-Lox可能通过Bcl-2途径发挥作用。Cox-2和5-Lox之间的表达无明显相关，二者可能存在间接的相互作用或者受其它因素路径的影响，其具体机制尚需进一步研究。