AECOPD不同临床类型痰微生物组研究

来源 :西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xfchen113001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)在全球具有高发病率,因COPD急性加重需住院治疗导致患者经济负担增加,并影响患者生活质量。而慢性阻塞性肺疾病急性加重期(acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease,AECOPD)常合并其他肺部疾病,加重患者病情影响预后。本研究通过高通量测序分析AECOPD,AECOPD合并哮喘与AECOPD合并支气管扩张不同临床类型的痰细菌组及真菌组的组成特征及多样性差异,同时探究不同中性粒细胞淋巴细胞比值(neutrophil lymphocyte ratio,NLR)痰菌群特点。从而深入解析AECOPD不同情况下微生物组成特征及变化,为临床诊治提供微生物方向思路。
  方法:于西南医科大学附属医院呼吸与危重症医学科收集诊断为AECOPD、AECOPD合并哮喘、AECOPD合并支气管扩张患者入院24小时内的痰液样品,同时收集患者临床资料。将痰样品依据纳入及排除标准筛选后分为AECOPD组(n=14)、AECOPD合并哮喘组(n=7)、AECOPD合并支气管扩张组(n=8)。AECOPD组内依据NLR中位数值分为高NLR组(High NLR,HNLR,n=7)与低NLR组(Low NLR,LNLR,n=7)。随后对痰样品进行基因组DNA提取,细菌选取V3-V4高变区进行16S rDNA(16S ribosomal Deoxyribonucleic Acid)高通量测序,真菌选取核糖体转录间隔1(Internal Transcribed Spacer1,ITS1)高变区进行高通量测序。对测序结果利用生物信息分析技术分析不同组间细菌及真菌构成,并进行α多样性和β多样性分析寻找组间差异。
  结果:1.AECOPD、AECOPD合并哮喘、AECOPD合并支气管扩张三组门水平上优势菌群均为变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门。属水平上优势菌群均为链球菌属、嗜血杆菌属、奈瑟菌属。真菌方面,门水平上优势真菌为子囊菌门和担子菌门,属水平上为念珠菌属,但不同组间菌群丰度不同。2.疣微菌门、螺旋体门、互养菌门丰度在AECOPD与AECOPD合并支气管扩张存在差异(p<0.05),紫单胞菌科与莫拉氏菌属丰度在AECOPD和AECOPD合并哮喘具有差异(p<0.05)。而AECOPD真菌组中子囊菌门、担子菌门与AECOPD合并哮喘、AECOPD合并支气管扩张组间菌群丰度无显著差异(p>0.05),属水平上念珠菌属丰度也无显著性差异(p>0.05)。3.AECOPD合并哮喘和AECOPD合并支气管扩张患者痰细菌β多样性较AECOPD患者增高,真菌多样性无显著性差异。4.HNLR组门水平主要由厚壁菌门组成,而LNLR组主要由变形菌门组成。属水平HNLR组优势菌属为链球菌属,LNLR组优势菌属为嗜血杆菌属。两组间变形菌门、嗜血杆菌属、链球菌属丰度具有显著差异(p<0.05)。5.HNLR与LNLR细菌组多样性分析发现HNLR组Chao1和Ace指数较LNLR组高,LNLR组β多样性增高。真菌组分析发现HNLR与LNLR组α多样性无显著差异,LNLR组β多样性增高。
  结论:通过高通量测序分析提高了菌群的检测,有利于不同组间菌群特征分析。AECOPD与AECOPD合并哮喘,AECOPD合并支气管扩张间痰细菌组构成及多样性具有差异。三组间真菌组菌群丰度不同,但菌群丰度及组间多样性分析无显著性差异。变形菌门、嗜血杆菌属、链球菌属丰度与AECOPD患者的NLR值具有一定相关性。
其他文献
目的:乳腺癌是女性常见恶性肿瘤。尽管许多研究已阐明乳腺癌的发病病因,但乳腺癌的发生分子机制仍然不清楚。由于乳腺癌具有发病率、转移率和死亡率高的特点,使得乳腺癌筛查、诊断和治疗方面成为了广大研究人员以及临床医生关注的焦点。EF手结构域1蛋白磷酸酶(Protein Phosphatase with EF-hand domain1,PPEF1)编码丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶,其异常表达与乳腺癌发生发展息息
学位
学位
期刊
目的:血小板的主要功能是参与止凝血和炎症反应等生理代谢过程,近年有大量研究发现血小板和肿瘤细胞之间会发生相互作用,形成一个有利于肿瘤生长的肿瘤微环境,帮助肿瘤细胞有效逃避机体免疫系统的监视,进行恶性生长或远处转移。血小板内含有丰富的mRNA,可以作为早期泛癌发生发展的潜在生物标志物,而实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)一直是量化样本中mRNA转录水平的关键。为了最大程度地减少实验误差
学位
学位
学位
目的:通过基于SPM软件的低频振幅(Amplitude of Low Frequency Fluctuation,ALFF)、分数低频振幅(fractional Amplitude of Low Frequency Fluctuation,fALFF)、局部一致性(Regional Homogeneity,ReHo)等分析方法探讨负性生活事件与首发青少年抑郁症脑功能活动的相关性,以便为未来进一步探
学位
学位
目的:  肺癌是最常见的肿瘤之一,其发病率高,五年生存率低。随着测序技术的发展,微生物组组成与肿瘤发生发展的相关性引起了广泛关注。已证实肺癌患者呼吸道微生物组组成与健康人的不同。但目前关于不同组织学类型肺癌患者呼吸道微生物组的研究仍较少,尤其缺乏关于肺癌呼吸道真菌组组成的研究。本研究旨在研究不同组织学类型肺癌患者呼吸道细菌及真菌微生物组的相关性及差异性,探索呼吸道菌群与临床特征的相关性,为肺癌的诊
学位
报纸